随着知识经济时代的发展及高等教育大众化的实现，高等教育在社会发展中的重要作用越来越突出。高校不仅为社会提供人才，而且也提供智力及技术支持。为了实现高校的社会功能的优化，高校内部管理体制的改革越来越成为关注的焦点。党的十六大后，中共教育部党组将“建立现代学校管理制度与运行机制”作为坚持教育创新，建成完善的中国特色社会主义现代化教育体系的重要内容。 本文从高校组织结构特点和高校内部事务出发，以学术权力与行政权力为重点进行分析。文章界定了学术权力与行政权力的概念，认为学术权力是学术组织或学术人员基于知识权威和学术自由，运用专门知识对学术活动及学术活动事务进行评判决策的权力。行政权力是以高校的行政系统和职能划分对学校中的行政事务和为学术活动提供服务的事务性工作进行组织和管理的一种权力。二者的辩证关系体现在：学术权力主导、行政权力辅助，学术权力与行政权力相互制约并相互协调。以此作为理论基础，通过对我国高校学术权力与行政权力运行现状进行分析，指出我国高校当前权力结构存在的主要问题及问题产生的原因。针对问题，文章中分析了耦合的条件，并在耦合原则指导下和的参考一些耦合模式设计了耦合的路径。最终从前提，关键，保障三个方面提出权力耦合的对策，以实现高校内部治理结构的完善，实现高校发展，为建设白主创新型国家提供支持。 本文第一部分提出了该选题的目的和意义，研究内容和所要解决的关键问题。并且介绍了当前国内外学者对于高校内部治理结构的研究概况及发展趋势，指出当前研究中存在的不足，并概括了该论文的主要创新点。 第二部分：高校内部治理结构的本质内涵及相关概念、原理。这一部分对高校内部治理结构的内涵进行了分析，并指出权力是高校组织结构中重要的组成要素。依据高校内部事务的特点，对高校学术权力和行政权力的概念进行了界定，分析了其联系和区别。通过对学术权力和行政权力的概念介绍及比较分析，结合一些权力结构模式的特征，这部分的最后一节对两权耦合的基本原理和必要性进行了介绍。 第三部分：我国高校学术权力与行政权力关系的现状及成因分析。这一部分中介绍了我国高校内部治理结构和权力结构的现状，重点对高校学术权力和行政权力的运作现状分析。文章指出学术事务管理的主体应是学术权力，依据的原则应是“学术决策，行政辅助”。但目前高校普遍存在学术权力弱化，甚至是学术权力行政化的倾向。人学中的各类管理人员借助行政组织的权威，为学术发展营造环境，促进学术发展，追求的价值目标应是公平、公正和效率，但是高校内部的行政系统影响甚至左右了学术系统，行政泛化现象严重。分析归纳总结当前高校权力结构中存在的主要问题，包括权力主体倒位，权力界限模糊，行为价值观念错位及实践中未能充分体现学术权力的合法性四个方面。并从高校知识性与科层性的内在组织结构特征，高校内部制度安排与运行机制，官本位意识及历史文化传统的影响三方面对问题的成因进行分析。第四部分：高校学术权力与行政权力耦合路径设计及建议。在耦合的基本原则指导和耦合的模式参考中，分析学术权力与行政权力耦合的条件，包括校长治校理念的更新，学术自由和权力制衡三方面。在此基础上设计提出了耦合的三条路径，确认学术权力的主体地位，实现学术回归：摆正行政权力的服务地位，保证正当行使；调整学术权力与行政权力的相互关系。最后提出耦合的对策建议。学术权力与行政权力的耦合前提是明确界定二者的作用领域；耦合的关键是强化学术民主制度建设；并将健全高校管理运行机制作为耦合的保障。 本论文从当前高校的实际情况出发，针对高校的特殊组织性质。在区别两种权力的前提下，以两种权力的共同服务于高校的发展这一目标为基点，对二者进行耦合细化分析，实现两种权力的协调发展，促进高校基本教育功能和组织目标的实现。文中针对高校的组织结构特点及权力结构在实际运作中的特点，分析并总结提出了行政权力与学术权力耦合的必要性，耦合的基本原理和基本原则，为实现高校内部治理结构的完善提供了依据。