【摘 要】
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目的:本课题旨在研究微卫星多态性分析技术（Polymorphic microsatellite markers,PMM）和重复序列PCR分析技术（Repetitive sequence-based PCR,REP-PCR）在临床热带假丝酵母菌基因分型中的应用,并比较两种分析技术的优越性,为临床热带假丝酵母菌准确分型提供技术依据。方法:收集2014年8月到2015年11月期间来自上海交通大学医学院附
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目的:本课题旨在研究微卫星多态性分析技术（Polymorphic microsatellite markers,PMM）和重复序列PCR分析技术（Repetitive sequence-based PCR,REP-PCR）在临床热带假丝酵母菌基因分型中的应用,并比较两种分析技术的优越性,为临床热带假丝酵母菌准确分型提供技术依据。方法:收集2014年8月到2015年11月期间来自上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海市儿童医院、上海市第一人民医院和上海市中山医院共4家医院临床分离的不同身体部位来源的热带假丝酵母菌共50株,样本来源包括痰液、粪便、尿液、血液、引流液等。经内转录间隔区序列分析（Internal transcribed sequence,ITS）进一步鉴定菌种后进行基因分型。第一部分:微卫星基因多态性分析技术（PMM）。采用Ctrm1、Ctrm10、Ctrm12三种微卫星标记进行微卫星多态性分析,获得微卫星基因型。第二部分:重复序列PCR分型技术。以引物Ca21、Ca22、Com21两两组合为引物,选出最合适的引物对进行扩增,后电泳获得REP-PCR基因型。比较两种基因分型方法的结果和分辨力。结果:经多态性微卫星分型技术分型得30种基因型,鉴别力指数（DP）为0.97。同一患者不同标本来源的菌株,其微卫星基因型别存在亚型;而重复序列PCR分型技术以Ca21-Com21引物组合为分型效果最好,50株热带假丝酵母菌经REP-PCR分型得到7种REP-PCR型,鉴别力指数（DP）为0.75。结论:微卫星多态性基因分型技术分析方法简便、快捷、分辨力高于重复序列PCR分析技术,同时可以观察同一患者不同部位分离的菌株是否有基因型的微进化,为后续的研究提供理论基础。
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