【摘 要】
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目的:建立一个与细胞焦亡相关的预后基因模型来预测肾透明细胞癌患者的生存状态。方法:从TCGA数据库下载肾透明细胞癌患者的基因表达谱和临床信息,通过Lasso Cox回归分析构建肾透明细胞癌预后风险评估模型,使用Kaplan-Meier生存曲线和ROC曲线验证预后模型的预测效果,再基于中位风险评分将肾透明细胞癌患者分为高风险组和低风险组,对两组患者进行GO、KEGG及单样本基因集富集分析。结果:我们
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目的:建立一个与细胞焦亡相关的预后基因模型来预测肾透明细胞癌患者的生存状态。方法:从TCGA数据库下载肾透明细胞癌患者的基因表达谱和临床信息,通过Lasso Cox回归分析构建肾透明细胞癌预后风险评估模型,使用Kaplan-Meier生存曲线和ROC曲线验证预后模型的预测效果,再基于中位风险评分将肾透明细胞癌患者分为高风险组和低风险组,对两组患者进行GO、KEGG及单样本基因集富集分析。结果:我们构建了一个由11个细胞焦亡相关基因组成的预后模型。Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险组的总生存期较低风险组明显降低（P＜0.0001）。预后模型1年、2年和3年的ROC曲线下面积分别为0.738,0.691和0.709,表明该预后模型具有中等预测能力。GO、KEGG及单样本基因集富集分析显示,免疫相关基因的富集程度高,高风险组中诱导的树突状细胞、中性粒细胞、肥大细胞、自然杀伤细胞和2型干扰素应答反应均低于低风险组,但CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞、炎症促进、T细胞共刺激和1型干扰素应答反应均高于低风险组。结论:我们的研究表明,由细胞焦亡相关基因组成的预后模型可以较好地预测肾透明细胞癌患者预后,并且细胞焦亡相关基因在肿瘤免疫中发挥重要作用。
其他文献
目的:观察焦磷酸钙沉积病（CPPD）与痛风性关节炎（GA）的肌骨超声声像图表现,探讨肌骨超声在鉴别CPPD与GA中的应用价值。材料和方法:回顾性分析本院经临床诊断并伴有四肢关节肿痛病史的82例CPPD和61例GA患者,收集患者的一般资料和肌骨超声声像图特征,比较两组患者受累部位的差异性,同时比较两组患者软骨钙化、双轨征、痛风石、肌腱内强回声、韧带内强回声、滑膜内强回声、骨侵蚀等超声直接征象发生率的
背景:帕金森病（Parkinson’s disease,PD）患者对左旋多巴治疗的反应性不同的原因尚不明确。既往研究表明左旋多巴反应性与PD患者脑白质损害相关,但目前尚缺乏PD患者脑白质损害导致的结构脑网络改变与其左旋多巴反应性之间的关系的研究。在本研究中,我们应用基于纤维束示踪的空间统计分析（Tract-based spatial statistics,TBSS）、确定性追踪（Determini
科里奥利质量流量计（简称科氏流量计）是一种直接式质量流量测量仪表，可以同时测量流体的质量流量、密度等参数。科氏流量计在使用过程中易出现挂壁故障，影响测量精度，因此，需要对挂壁故障进行定期检测。检测所采集的数据质量会影响科氏流量计挂壁故障检测的精度，针对此问题，必须对脏数据进行清洗，进一步提高科氏流量计挂壁故障检测的准确率，提出了一种基于强化学习的数据清洗算法。将数据与后端机器学习模型相结合，使用Q
目的:采用高分辨颅脑T1加权成像（T1-weighted image,T1WI）图像和基于影像组学的人工智能技术,来开发和验证用于预测轻度认知障碍（Mild cognitive impairment,MCI）至阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease,AD）是否转化及转化时间（time to progression,TTP）的模型,并建立多预测因子诺莫图。方法:本研究共纳入162名MC
目的:比较不同药物干预措施对改善动脉瘤性蛛网膜下腔出血（aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage,aSAH）术后患者临床预后的疗效,并筛选和确立改善临床预后疗效最佳的药物。方法:从 PubMed、EMBASE 和 Cochrane Library（建库至-2020年9月）数据库中搜索符合纳入及排除标准的随机对照试验（Randomized Controlled Trial
目的:通过荟萃分析比较新辅助治疗（neoadjuvant chemoradiotherapy,n CRT）后行侧方淋巴结清扫（Lateral pelvic lymph node dissection,LLND）对比新辅助治疗（neoadjuvant chemoradiotherapy,n CRT）后仅行全直肠系膜切除术（total mesorectal resection,TME）治疗中低位进展期
背景:肝细胞肝癌（HCC）是原发性肝癌的主要病理亚型,恶性程度高,预后不理想。现临床阶段中肝癌免疫疗法已成为除手术治疗,肿瘤血管介入栓塞治疗外另一种有价值的疗法。肿瘤突变负荷（TMB）目前被认为是预测免疫治疗效果最普遍的生物标志物之一。然而,特定基因突变及其与HCC中TMB和肿瘤浸润性免疫细胞的关系尚不完全清楚。我们因此探讨TMB、HCC预后和肿瘤免疫浸润之间的关系,以确定HCC的关键基因。方法:
背景与目的:认知功能障碍（CI）是帕金森病（PD）常见的非运动症状,早期预测认知正常的PD患者是否以及何时发生CI对于疾病的预后至关重要。本研究旨在联合多方面的基线信息建立不同的预测模型,用于个体化评估PD患者进展为CI的风险以及进展时间。方法:从PPMI数据库中纳入了108例PD患者,在5年的随访过程中有58例进展为CI,50例仍稳定在正常认知范围。首先,采用最小绝对收缩和选择算子（LASSO）
细胞焦亡被定义为一种以成孔效应蛋白介导的炎性程序性细胞死亡方式。研究发现,细胞焦亡与肿瘤的发生、侵袭及预后有关。肾乳头状细胞癌（KIRP）是一种泌尿系统常见的肿瘤,文献提示可能与细胞焦亡存在一定的关联,但具体作用不清楚。研究中,我们利用生物信息的方法针对52个与焦亡相关基因（PRGs）在28个正常肾脏组织和249个KIRP组织中的表达情况进行了综合分析,发现20个差异表达基因。进一步进行一致性聚类
研究背景:随着加速康复外科理念及电视胸腔镜手术的发展,胸腔镜手术后不留置胸腔引流管的概念被提出,本系统评价和荟萃分析的目的是确定胸腔镜下肺楔形切除术后不留置胸腔引流管与常规留置胸腔引流管相比,是否具有安全性和有益性。方法:全面检索Pub Med数据库、Web of Science数据库、Cochrane Library数据库、Ovid数据库、万方医学数据库、CNKI数据库从成立到2021年12月2