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外周动脉硬化闭塞症(PAD)是全身性动脉硬化的一种主要表现形式，它影响了大约800-1000万美国人的身体健康。研究表明患有PAD疾病的病人发生心肌梗死和中风的概率比不患有PAD的病人要高四到五倍。然而，对PAD疾病的发生和发展的机制至今仍不是很清楚。本次研究使用Affymetrix芯片对临床PAD样本进行基因表达谱分析，筛选与PAD疾病发展密切相关的基因，为从分子水平上更好的阐述PAD发病的机制提供线索。本研究主要包括以下内容(1)我们收集了30多例的临床PAD样本和5例正常股动脉样本，在对样本进行病理分类后，我们使用Affymetrix HG-U133A芯片对14例advanced lesions，11例intermediate lesions和5例正常股动脉样本进行了基因表达谱实验，并使用real-time PCR对部分芯片结果进行了验证。(2)我们使用Significance Analysis of Microarrays(SAM)软件筛选差异表达的基因。在假阳性率(FDR)小于0.5％的情况下，我们发现共有614条基因在疾病发展的过程中发生显著的变化，进一步使用非监督的聚类分析方法发现，这些基因可以被分成三个主要的类群。在疾病发展的不同阶段，SAM筛选发现，与正常股动脉样本相比较，在intermediate lesions样本中共有366条基因发生显著的调变包括230条显著上调的基因和136条显著下调的基因，而在advanced lesions中发生显著调变的基因数目为447条，包括172条显著上调的基因和275条显著下调的基因。在这些显著调变的基因中，共有116条基因在intermediate lesions和advanced lesions均发生显著的调变，包括68条共同上调的基因和48条共同下调的基因。进一步的文献检索发现免疫和炎症相关的基因在PAD发展的不同阶段均发生显著性的上调(在intermediate lesions中上调的230条基因中有85条被报道参与了免疫反应，而在advanced lesions中上调的172条基因中有37条基因被报道参与了免疫反应).(3)通过Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopediaof Gene and Genomics(KEGG)，我们对筛选出的基因进行功能分析，结果显示在疾病发展的不同阶段，immune／inflammtory response均可以被显著的富集出来(P＜0.05)。表明免疫和炎症反应与疾病的发展是密切相关的。此外，免疫相关的信号传导通路如Toll样受体介导的信号通路(Toil-like receptorsignaling)和自然杀伤细胞介导的细胞毒性(natural killer cell mediatedcytotoxicity)也在intermediate lesions和advanced lesions中被显著的富集出来(P＜0.05)，显示了它们在疾病发展的过程中发挥了重要的作用。western-blot进一步验证了Toil-like receptor7在PAD样本上显著表达。结论，我们的研究结果不仅支持了主要在动物水平和其它来源的动脉硬化组织研究中所形成的假设即炎症反应影响了PAD疾病的发展，而且表明一组特定的免疫和炎症反应基因可以作为疾病发展不同阶段的标志。通过对这些基因的进一步的研究可以为深入理解PAD的发展机制，设计治疗PAD的药物奠定基础。