改革开放以来，西藏农民收入增长不平衡、增长速度缓慢，城乡收入差距加大以及与全国的收入差距不断扩大。如何解决这些矛盾，扎实推进社会主义新农村建设，是“十一五”时期的重要任务。作为政府行使其职能的重要手段和工具之一，财政支农支出毫无疑问成为政府对农业支持和保护的主要渠道和手段。政府为了更好地实现对农业的支持和保护，也必须运用财政手段。本文通过对1989-2007年间西藏财政支农支出与西藏农牧民收入数据作为样本，扣除通货膨胀因素以1989年农村消费价格指数作为基期，做可比价转换，分析出两者间的关系和变动趋势等分析，并运用计量分析方法对该样本数据进行单位根检验、协整检验、格兰杰因果检验等，分析出西藏财政支农支出与农民人均收入之间的关系及西藏财政支农各分项对西藏农牧民收入的影响。结果显示，从总量分析，西藏财政支农支出对下一年农牧民收入具有显著影响；从支农结构分析，财政扶贫资金、支援农村生产类支出对农牧民收入具有显著影响；农业基本建设资金对农牧民收入影响较小；农业科技三项经费对农牧民收入并不显著。因此，要加大财政支农支出投入，同时我们应在财政支农资金有限的情况下，增加生产性支出和财政扶贫资金的比重，加大财政补贴政策；农业基本建设资金对农牧民收入的影响较小，一是由于农业基础设施的建设具有一定的滞后期，二是农业基本建设资金的利用和效率问题也值得深思(从2000年以后农业基本建设资金占财政支农总计的比重为最大)，需要提高财政支农资金使用绩效；而农业科技三项经费用对农牧民收入并不显著是投入总量长期不足以及在投入过程中发生损失。