人类基因组计划已经完成,蛋白质组学研究成为生命科学研究的前沿。复杂蛋白样品的预处理在蛋白质组分析中具有重要意义。自由流电泳(FFE)与常用的凝胶电泳法和毛细管电泳法相比的突出特点是可连续进样分离。FFE的微型化有利于克服大型FFE中的焦耳热问题,更适合少量样品的快速分离。第一章对FFE及其应用进行了综述,特别对近年来芯片FFE的发展及存在的问题进行了分析,提出了可能的改进方法,并对其在蛋白质分析中的应用进行了展望。第二章介绍了一种简单快速加工自由流电泳芯片的方法。首先利用光刻方法在ITO玻璃上制作ITO电极,然后将其和玻璃盖片用双面胶粘合的方法制备了FFE芯片。以荧光素钠和罗丹明6G为探针,利用荧光成像法对该芯片的分离特性进行了表征,对支持电解质的浓度、流量和pH值及电场强度等因素的影响进行了研究。第三章采用光刻和热封合的方法制作了具有厚度仅为15μm的10 mm宽的FFE分离通道的全玻璃FFE芯片,采用电极通道法引入50μrn铂丝电极。对该玻璃芯片进行了表征,比较了其与ITO玻璃FFE芯片的不同。第四章结合毛细管电泳仪测得的荧光素钠、罗丹明6G的淌度对芯片FFE分离中的某些现象进行了分析,重点讨论了电渗流的存在对FFE分离的可能影响。利用所建立的具有大跨度分离通道的芯片FFE已经成功地用于自由区带模式的分离,为下一步其它分离模式及相关的应用研究打下了良好的基础。