【摘 要】
：
山羊的卵巢是决定其繁殖力的重要器官。卵巢的功能调控是一个复杂的过程,受众多激素和基因的共同影响,在产羔性能不同的山羊卵巢中,可能存在表达量差异的相关因子。目前,提高山羊生产力是山羊育种者最重要的目标之一,但是调控山羊繁殖的分子机制尚不清楚。本研究通过转录组测序技术（RNA-Seq）,结合生物信息学分析等方法,研究我国川中黑山羊高繁羊（≥3胎,每胎≥2羔）和低繁羊（≥3胎,每胎=1羔）mRNA及ln
【基金项目】
：
广东省乡村振兴战略专项“广东省畜禽地方品种保护与开发利用提升工程”项目（4300-F18260）； 广东省教育厅青年创新人才项目（2017KQNCX014）； 广东省科技厅公益研究与能力建设（2017B020201014,2017A020208050）；
论文部分内容阅读
山羊的卵巢是决定其繁殖力的重要器官。卵巢的功能调控是一个复杂的过程,受众多激素和基因的共同影响,在产羔性能不同的山羊卵巢中,可能存在表达量差异的相关因子。目前,提高山羊生产力是山羊育种者最重要的目标之一,但是调控山羊繁殖的分子机制尚不清楚。本研究通过转录组测序技术（RNA-Seq）,结合生物信息学分析等方法,研究我国川中黑山羊高繁羊（≥3胎,每胎≥2羔）和低繁羊（≥3胎,每胎=1羔）mRNA及lncRNA的表达差异,探究他们的功能及参与的信号通路,揭示相关基因及lncRNA在调控发情期高繁和低繁川中黑山羊卵巢功能的分子机制,为了解与山羊繁殖力有关的分子遗传机制提供理论依据,也可为优质高产山羊科学选种选育奠定基础。主要研究结果如下:（1）在低繁殖力和高繁殖力山羊之间共筛选了1353个差异表达的mRNA（P＜0.05）和168个差异表达的lncRNA（P＜0.05）;其中,PVALB（P＜0.01）的差异表达最为显著,PVALB的表达与类固醇产生有关,其显著上调可能影响山羊卵巢的功能。此外,差异表达并在高繁山羊中显著上调的RXRG（P＜0.05）在母畜的繁殖过程中起重要作用,可作为母畜繁殖力的候选分子标记。通过实时荧光定量PCR（q RT-PCR）的方法验证了随机选择的差异表达mRNA和lncRNA,定量结果与测序结果基本一致。（2）差异表达mRNA的GO Term主要与多细胞生物进程、质膜组成及质膜的活动有关,推测在发情期高繁羊卵巢的物质交换频繁以及细胞活动较为旺盛,其中参与多细胞生物进程条目的IL1R2对山羊繁殖性能可能有显著影响,可作为评价山羊繁殖力的候选基因。mRNA的KEGG信号通路富集分析表明,差异表达的SRD5A2、LOC102191297和LOC102171967等基因参与了类固醇激素生物合成的代谢通路,该通路与动物繁殖力密切相关。（3）lncRNA的靶基因KEGG信号通路富集分析表明,lncRNA的靶基因MYC、SMAD6和BMP2富集在TGF-β信号通路上,lncRNA可能通过介导MYC、SMAD6和BMP2的表达,影响TGF-β信号通路的正常调控,进而调控高低繁川中黑山羊卵巢的功能。（4）mRNA-lncRNA联合分析表明,差异表达的lncRNA ENSCHIT00000005909和ENSCHIT00000005910通过调控差异表达的IL1R2,进而调控卵巢的功能,影响山羊的产羔数。本研究以卵巢组织为试验材料,从转录组层面分析了可能导致山羊产羔数差异的mRNA和lncRNA,初步筛选到一些影响山羊繁殖性能的关键基因,并阐述了导致山羊繁殖力差异的分子机制,研究结果为解释山羊多羔性状形成的遗传机制提供了理论基础,也为优质高产山羊品种的选育提供了科学指导。
其他文献
小菜蛾Plutella xyllostella（Linnaeus）,属鳞翅目,菜蛾科,是世界性十字花科蔬菜的重要害虫,是抗药性发展最为严重的害虫之一。小菜蛾繁殖力强,发生世代短,变异快,遗传可塑性好。长期利用化学方法防治小菜蛾,不仅对环境造成破坏,而且造成小菜蛾对多种农药的抗药性迅速增强。发展小菜蛾的绿色防控技术势在必行。昆虫辐照不育技术具有对环境友好、无化学残留、不产生抗药性等优势,是一种安全有
直播稻田杂草种类多、发生量大,是限制直播水稻发展的一大难题。目前,防治直播稻田杂草最重要的措施是施用化学除草剂。但施用化学除草剂劳动强度大,劳动成本高。种子丸粒化是一种可以防治苗期病虫草害、省工省时的技术。但是,目前关于除草剂水稻种子丸粒化包衣的安全性及对杂草的防控未见相关报道。本文使用种子丸粒化技术,对嘧草醚、吡嘧磺隆和苄嘧磺隆三种高效除草剂进行筛选,研究了除草剂种子丸粒化包衣对直播水稻的安全性
柑橘木虱（Diaphorina citri Kuwayama）属半翅目（Hemiptera）木虱科（Psyllia）,其寄主为柑橘、九里香等芸香科植物,成虫、若虫均能给柑橘造成危害,引起嫩梢干枯、叶片畸形,其排泄物还会引起煤烟病,但其最重要的危害是传播柑橘黄龙病。至今为止,尚未发现可以对柑橘黄龙病进行根治的防治药剂,所以,通过控制柑橘木虱种群发生量是抑制柑橘黄龙病传播的重要手段之一。利用杀虫剂控制
拟除虫菊酯类农药是一类广谱高效的仿生型农药,是继有机磷、有机氯和氨基甲酸酯的一类新型杀虫剂,约占现今世界市场的20%,被广泛应用于农产品生产和生活卫生害虫的防治中。拟除虫菊酯类农药大范围使用导致了其在环境中大量残留,环境中残留的拟除虫菊酯伴随地表径流污染水生系统,导致水产品质量下降并通过食物链和食物网的放大最终危害人体健康。微生物降解是当前解决农药残留问题的主要途径。本研究选取杀虫活性高、但残留期
随着化学杀虫剂的不合理施用以及农药开发越来越苛刻的要求,使得害虫的抗性日益严重,造成了杀虫剂使用量的大幅增加,而防治害虫的效果却大大降低。另一方面,也面临着杀虫剂不易降解、高残留、对非靶标生物高毒等环境问题。因此,在很大程度上缩短了商品化杀虫剂的使用寿命。在此严峻的形势下,课题组前期采用骨架跃迁的策略,在芳基吡唑类杀虫剂的基础上开发了新型5,5-二取代-4,5-二氢吡唑并[1,5-a]喹唑啉化合物
氯氟氰虫酰胺是新一代邻苯二甲酰胺类杀虫剂,由浙江省化工研究院自主研发。本文建立了氯氟氰虫酰胺在水体和土壤中的残留分析方法,研究了氯氟氰虫酰胺在不同环境介质中的水解、光解、土壤降解趋势及在土壤中的吸附-解吸附作用等环境行为,旨在评估氯氟氰虫酰胺的环境安全性,指导其科学合理使用。主要结论如下:（1）建立了氯氟氰虫酰胺在土壤和水体中的分析检测方法。水体样品经二氯甲烷萃取,土壤样品用乙腈超声提取,采用PS
胶冻样类芽孢杆菌（Paenibacillus kribbensis）PS04是本课题组分离得到的菌株。前期研究表明PS04菌株代谢产物具有广谱抗真菌活性,对稻瘟病和纹枯病病原菌的防治效果显著,胞外多糖能够诱导植物防御酶的活性增加。本研究旨在通过全基因组测序获得胶冻样类芽孢杆菌PS04菌株基因组的基因信息;了解PS04菌株与其余五种类芽孢杆菌在基因层面的差距;通过液相色谱与质谱联用（LC-MS）的代
学习与记忆是两个密不可分的神经活动过程,是昆虫适应环境以及搜寻寄主和食物的重要能力之一。章鱼胺（Octopamine,OA）普遍存在于昆虫体内并调控其学习与记忆行为。桔小实蝇是一种重要的检疫性果蔬害虫,田间以花蜜、花粉为食,通过学习判定食物的营养价值对于其在田间快速获取有营养的食物至关重要。本研究采用经典条件训练法明确桔小实蝇雄成虫在不同糖刺激下联合甜橙精油的奖赏性嗅觉学习能力,并探究了章鱼胺对其
对现代化生产的养猪场而言,后备母猪初情启动日龄与猪场的经济效益密切相关。母猪初情期是指在下丘脑-垂体-卵巢轴的调控下,母猪第一次发情并排卵,标志着其机体达到性成熟,并开始具有繁殖能力。研究表明,母猪初情启动日龄与初产日龄具有较高遗传相关,且初情启动日龄能够影响母猪终身繁殖性能和淘汰胎次。因此,母猪初情启动的提早,将对提高猪场的经济效益具有重要意义。本研究通过对初情启动前后两个关键时期:初情期前和初
戊唑醇是一种使用量大且效果好的三唑类手性杀菌剂,含有一个手性原子,一对对映体。对映体之间在生物活性、环境行为和毒性存在差异。目前戊唑醇以外消旋体生产和使用,但关于戊唑醇对映体在葱种植体系中的选择性降解行为还未见报道。另外,生态环境中重金属污染普遍存在,重金属对手性农药对映体的选择性行为的影响,以及戊唑醇在小宗作物葱上的消解行为和残留规律还未见研究,这不利于它的安全使用和评价。为此,本论文研究了手性