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目的：大多数胃肠道间质瘤(GIST)存在c-kit或血小板源性生长因子受体α(PDGFR a)基因功能获得性突变,并成为伊马替尼的作用靶点。本研究拟分析GIST中c-kit及PDGFRα基因突变的发生率、常见的发生部位及突变类型,并进一步探讨GIST基因突变状态与临床病理学特点、伊马替尼疗效和预后的关系。方法：第一部分对大连医科大学附属第一医院2004年9月～2010年3月收治的30例GIST患者术后肿瘤蜡块用PCR扩增和基因直接测序的方法检测其组织中c-kit基因第9、11、13、17号外显子和PDGFRα基因第12、18号外显子的序列,分析GIST基因突变特点,并探讨基因突变状态与肿瘤原发部位、大小、细胞形态、核分裂象、危险度分级的关系。第二部分以上30例患者中,15例术后复发或转移的GIST患者接受了伊马替尼治疗。依据Choi标准对15例患者伊马替尼的疗效进行了评价,分析其基因突变状态与伊马替尼疗效及预后的关系；并分析疗效与生存期之间的关系。结果：第一部分30例GIST患者中,24例存在c-kit／PDGFRα基因突变(80.00%),余6例为野生型患者(20.0(?)%)。存在突变的患者中,c-kit基因突变者19例(79.17%),PDGFRα基因突变者5例(20.83%)。c-kit基因突变者中,突变发生在9号外显子的有6例(31.58%),发生在11号外显子的有13例(68.40%),未检测到发生在13号和17号外显子的突变。c-kit基因突变的特点为：发生点突变者：6例(31.58%),缺失突变者6例(31.58%),重复插入突变者6例(31.58%),有1例(5.26%)同时存在11号外显子的点突变和缺失突变；11号外显子突变多集中在其5’端的552-560密码子,且5’端的突变以点突变和缺失突变为主；9号外显子突变均为502-503密码子的6个核苷酸(GCCTAT)串联重复插入。5例PDGFRα基因突变者中,突变发生在第18号外显子的有4例(80.00%),发生于第12号外显子的有1例(20.00%)；18号外显子的突变主要表现为D842V突变。结果显示基因突变的发生率与肿瘤原发部位及细胞形态相关。原发于胃的GIST突变率、c.kit基因突变率以及c-kit基因11号外显子突变率均高于小肠、大肠及胃肠道外部位,差异具有显著性(X2=6.771,P=0.034；X2=8.298,P=0.016；X2=6.302,P=0.043)。细胞形态为梭形细胞者突变率、c-kit基因突变率及c-kit基因11号外显子突变率均高于上皮型及混合型,差异具有显著性(X2=7.243,P=0.027；X2=7.304,P=0.026；X2=8.081,P=0.018)。GIST不同基因型在不同的原发部位和细胞形态组差异无显著性(P>0.05)。此外,GIST基因突变率及不同基因型在不同的性别、年龄、肿块大小、核分裂数和危险度分级组差异无显著性(P>0.05)。第二部分按照Choi评价标准,对接受伊马替尼治疗的15例术后复发或转移的GIST患者进行了疗效的评估。15例患者中,突变者12例(80.00%),无突变者3例(20.00%)；11号外显子突变者6例(40.00%),其他突变者6例(40.00%)。突变者中,获得完全缓解(CR)者1例(8.33%),部分缓解(PR)者5例(41.67%),疾病稳定(SD)者3例(25.00%),疾病进展(PD)者3例(25.00%)；无突变者中,获得PR者1例(33.33%),SD者2例(66.67%),无CR及PD者。11号外显子突变者中CR者1例(16.67%),PR者3例(50.00%),SD者2例(33.33%),无PD者；其他突变者中,PR者2例(33.33%),SD者1例(16.67%),PD者3例(50.00%),无CR者。此15例患者总的有效率(RR)为46.67%(7／15),疾病控制率(DCR)为80.00%(12／15)；突变组与无突变组、11号外显子突变组与其他突变组间在CR、PR、SD、PD、RR、DCR上无显著差异(P>0.05)。伊马替尼的不良反应主要为Ⅰ-Ⅱ级,患者尚可耐受。中位随访时间28个月,突变组中位至疾病进展时间(TTP)为25个月,无突变组为21个月,两组的2年无进展生存(PFS)率差异无显著性(P>0.05)。11号外显子突变组的2年PFS率明显高于其他突变组和无突变组,差异具有显著性(X2=6.078,P=0.048)。不同的突变类型组间2年PFS率差异无显著性(P>0.05)。结论：1、GIST基因突变中最常见的为c-kit基因突变,其次是PDGFRα基因突变；c-kit基因突变最常发生于11号外显子,其次为9号外显子；PDGFRα基因突变最常发生于18号外显子,其次为12号外显子。C-kit基因11号外显子突变多集中在5’端的552-560密码子,且以点突变和缺失突变为主；9号外显子突变多表现为重复插入突变；PDGFRα基因18号外显子突变多表现为D842V突变。2、GIST基因突变与肿瘤原发部位及细胞形态相关。原发于胃的GIST突变率高于原发于小肠、大肠以及胃肠道外部位者,差异有显著性；细胞形态为梭形细胞者突变率高于上皮型及混合型,差异有显著性。3、伊马替尼在复发或转移性GIST中的疗效确切,并且伊马替尼对11号外显子突变者疗效优于其他突变者和无突变者。4、对GIST患者疗效评价标准Choi标准与Recist标准相比,与GIST远期疗效(生存期)相关。