基于带有连续延时的ODE模型的基因调控关系的识别

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多年来,基因之间调控关系的识别研究层出不穷。本文主要提出带有连续延时的常微分方程模型来刻画两两基因之间的调控关系,然后进行模拟数据试验,并用此模型判别真实的两两基因对之间是否有调控关系。首先,我们建立了带有连续延时的常微分方程模型;其次,基于真实实验数据,我们模拟生成有调控关系以及没有调控关系的基因对数据;然后,我们将模拟数据代入我们提出的带有连续延时的ODE模型中并求解相关参数,再选取相应特征对判别基因对之间是否有调控关系的SVM分类器进行训练与测试,我们得到测试准确率高达89.5%;再次,我们比较了所提出的模型和线性模型应用在相同模拟数据上的结果的优劣,得到我们提出的模型能更好地刻画基因对之间的调控关系;最后,我们将训练好的SVM分类器运用到真实数据上来判别两两基因之间是否有调控关系。
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