5-羟甲基胞嘧啶在大鼠脑组织中分布及发育作用的研究

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背景和目的:5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)是最近在哺乳动物中发现的一种新的表观遗传修饰碱基,5hmC是5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)在TET蛋白(Ten-Eleven Translocation)的羟基化作用下产生的。5hmC的具体功能还不知道。已知的5mC与MeCP2(methyl-CpG binding protein2)结合后能够抑制基因的转录,并有研究发现5hmC能够抑制5mC与MeCP2的结合,这提示我们5hmC与5mC在表观遗传上可能存在互补的作用。先前的研究已经证实5hmC广泛分布于小鼠和人的大脑组织,并且在小鼠海马和小脑的5hmC水平随着年龄的增长而增长。除此之外,大量的体外实验证实5mC在强氧化性物质(如芬顿溶液和紫外线照射的充气水溶液)的作用下可以产生5hmC。因此5hmC也被认为是DNA氧化应激损害的产物之一。基于这些理论,我们来检测大鼠大脑的各部分组织中是否也存在5hmC的修饰方式,并且如果我们证实了大鼠纹状体中确实存在5hmC,接下来我们可以探讨大鼠纹状体中5hmC的量会不会也随着大鼠年龄的增长而增长。6-羟基多巴胺(6-hydroxydopamine,6-OHDA)诱导的SD大鼠是帕金森氏病(Parkinson’s disease, PD)的经典动物模型,已经有许多证据证实该动物模型与氧化应激有关。因此我们使用该模型来研究大鼠纹状体的5hmC是否会因体内氧化应激的存在而发生改变。方法:运用三组不同年龄段的雄性SD大鼠,包括出生后1天(新生鼠),出生后21天(青春期鼠)和出生后65天(成年鼠),每组各6只取双侧纹状体。6-OHDA诱导的雄性SD大鼠是经典的PD动物模型,在实验中我们设立PD组,假手术组和正常对照组,每组各6只并取其右侧的纹状体。取6只成年雄性SD大鼠的大脑组织中的双侧纹状体,双侧大脑皮层,双侧小脑,双侧海马和双侧脑干。提取这些组织的全基因组DNA。用5hmC的ELISA试剂盒检测这些组织基因组DNA中5hmC的含量。运用独立样本的T检验和one-way ANOVA对组织样本基因组DNA中5hmC的含量进行相关的统计学分析。用Graphpad Prism5软件作图。结果:我们发现在检测的大鼠的脑组织中也广泛的存在5hmC,并且5hmC在这些组织中的分布是组织特异性的。5hmC在大鼠的大脑皮层中占0.159%,在大鼠的海马组织中占0.063%,在大鼠纹状体中占0.058%,在大鼠脑干中占0.040%,在大鼠的小脑中占0.032%。我们还发现出生后21天大鼠纹状体中5hmC的量与出生后1天大鼠纹状体中5hmC的量有明显差异(P<0.05),出生后65天大鼠纹状体中5hmC的量与出生后21天大鼠纹状体中5hmC的量也有明显差异(P<0.05)。通过趋势检验和曲线回归分析发现出生后1天至出生后65天,大鼠纹状体中5hmC的水平呈逐渐增长的趋势。但是与正常成年大鼠和假手术大鼠相比,在6-OHDA诱导的PD大鼠中纹状体5hmC的量并没有明显差异(P>0.05)。结论:我们首次揭示了大鼠大脑组织中5hmC的分布,特别的是,我们首次揭示哺乳动物的纹状体中存在5hmC的修饰方式。另外大鼠纹状体中5hmC的量随着大鼠年龄的增长而增长。但是与正常成年大鼠和假手术大鼠相比,6-OHDA诱导的PD大鼠的纹状体中5hmC的量并没有显著改变。
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