水稻作为全球几十亿人的主食,其重要性不言而喻。保障粮食安全,培育高产、优质、高抗的水稻品种是水稻育种的核心目标。骨干亲本是水稻育种的重要基础,在我国育种实践中,一系列水稻骨干亲本的形成、应用和发展极大地推动了育种进程。黄华占作为新一代籼稻骨干亲本,综合性状优良,目前已在中国南方稻区大面积种植并衍生出了多个品种。现有研究表明,水稻骨干亲本是一个或多个优良性状的集合体,这源于一系列优质遗传组分的精巧组合。虽然近年来利用骨干亲本已经定位到一些调控水稻关键性状的遗传座位,但目前对控制黄华占优良性状形成关键遗传座位的来源和传递关系还知之甚少。为了系统研究黄华占优良性状的形成过程和遗传机制,我们以黄华占和其育种谱系的各代亲本为对象,通过传统遗传学手段和现代分子生物学技术,着重分析了黄华占高产、优质等重要农艺性状的来源和贡献于这些性状的遗传基础。我们的研究结果表明:1.黄华占谱系品种在产量和品质等农艺性状上存在着巨大的差异:产量最高的是桂朝2号,最低的是朝阳早18,黄华占属于中高产的水平;在稻米品质方面,黄华占的综合品质最优,而桂朝2号等前期亲本品质很差。总的来看,黄华占的选育经历了“高产劣质—低产优质—中高产优质”的过程。2.二次枝梗数和千粒重是黄华占谱系品种产量的决定性因素。以桂朝2号为代表的前期亲本具有很高的二次枝梗数,Ghd8^ZYZ这种新型等位可能对穗粒数有积极贡献,28占对二次枝梗数产生了严重的负效应,致使后期品种产量降低。千粒重与粒型相关,长丝占贡献了gs3和gs5两个关键等位,导致谱系品种由圆粒型转变为长粒型,千粒重的降低对产量产生了负效应。3.垩白和直链淀粉含量是影响黄华占谱系品种稻米品质的关键性状。从桂阳矮49到特青,稻米品质粗糙,主要表现在胚乳腹部垩白度高和直链淀粉含量高两方面。长丝占提供了低腹白的H94型Chalk5基因,28占带来了低直链淀粉含量的Wx^b基因,这两个等位基因是黄华占优质的重要遗传基础。4.基于SNP和indel进行的非加权组平均法（UPGMA）聚类分析表明,黄华占谱系品种主要被分为两支,其遗传相似性与谱系关系和表型相似度基本一致。我们的研究工作初步揭示了黄华占中多基因性状以及综合优良性状形成的遗传规律,为进一步挖掘黄华占优良综合性状提供了基础。