本文阐述了马克思主义关于制度的内在两层结构的观点：经济上的“权力结构”和由其衍生出政治法律上(即法权上)的“权利结构”，并对制度的一般价值展开分析：自由，伦理，秩序；制度与经济发展的内在关系是；从制度本身的运行机制引起的经济发展变化分析，突显其在经济增长中的基础性地位；从制度的动态变迁理论影响的经济增长分析，显现了制度变迁是经济增长的根本性原因；从产权以及产权制度与经济增长的相互关系分析，说明了产权与产权制度在经济增长中所起的保障性作用。这三个层次的分析都采用了比较方法、理论与实践的分析方法，在坚持以马克思主义理论为指导性的原则下，通过马克思主义与非马克思主义有关制度以及相关方面的理论比较，分别得出了有关制度在经济上的(基础、根本原因、保障性)价值结论；最后，本文在分析当前中国经济制度缺失的表现的基础上，还结合与解读了中共十六届三中全会的基本文件，提出了中国经济制度创新的几点建议：政府职能转变和机构改革，城乡体制改革，产权制度改革，政治体制改革和思想观念的转变。