高通量测序分析前列腺癌相关miRNA表达谱及miR-4485-3p在前列腺癌中的表达与意义

来源 :新疆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lichangsong3
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目的:通过高通量测序技术(High-throughput Sequencing)建立前列腺癌(Prostate Cancer,PCa)相关微小RNA(micro RNA,miRNA)表达谱,并通过生物信息学分析探讨其功能和作用。检测miR-4485-3p在前列腺癌与良性前列腺增生(Benign Prostatic Hyperplasia,BPH)患者中的表达量,探讨其对前列腺癌的临床意义与诊断价值。方法:1.收集不同民族前列腺癌及良性前列腺增生患者穿刺组织样本,借助高通量测序技术,建立前列腺癌相关miRNA表达谱并获得差异表达miRNA,预测其靶基因。对靶基因进行生物信息学分析,探讨其生物学功能及所涉及的信号通路。最后,通过逆转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription-PCR,RT-PCR)技术测定差异表达miRNA在两组中的表达量。2.运用RT-PCR技术检测miR-4485-3p在各组织中的表达水平,统计分析miR-4485-3p表达水平与患者临床分期、病理特征的联系。结果:1.试验组与对照组miRNA表达谱序列中显著差异表达miRNA为42个,其中上调11个下调31个,选出差异较显著的5个miRNA。生物信息学分析显示差异miRNA的靶基因富集于谷氨酸代谢过程的调节细胞反应,功能分析显示差异miRNA的靶基因主要参与PI3K-Akt信号通路,细胞骨架调节相关蛋白通路等代谢通路。利用RT-PCR方法扩大样本量验证这5个基因在两组中无明显差异,原因可能是由于样本量较少而未呈现出统计学差异。2.miR-4485-3p在前列腺癌组织中的表达量显著高于良性前列腺增生组织,差异有统计学意义(P<0.05)。癌组织中miR-4485-3p的表达在不同前列腺特异性抗原(Prostate-Specific Antigen,PSA)表达水平、格里森评分(Gleason score,GS)、临床分期及有无骨转移上差异无统计学意义(P>0.05)。结论:1.不同民族中差异表达的miRNA在前列腺癌的发生发展中可能发挥重要作用。2.miR-4485-3p在前列腺癌中呈现上调表达,提示其可能参与前列腺癌的发生发展过程,成为前列腺癌早期辅助诊断的潜在生物标志物。
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