人类胎盘环状RNA的图谱建立及其功能分析

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circRNA是一类特殊的非编码RNA,有文献报道细胞和组织中有超过10%的表达基因可以产生circRNA[1],表明circRNA的表达是广泛存在的。由于其稳定性,进化上的序列保守性,在组织或发育阶段的表达特异性,circRNA已经成为继miRNA和lncRNA之后又一研究热点。已有研究报道circRNA在众多疾病、肿瘤以及干细胞中均具有重要的调控作用。胎盘是哺乳动物胚胎发育中最早形成的临时性器官,是母体与胎儿间进行物质交换的场所,在胚胎发育的过程中也有重要的作用。胎盘发育异常与子痫前期、胎盘植入等多种妊娠疾病相关。子痫前期(Preeclampsia)作为妊娠期特有的疾病,可危及孕产妇及胎儿生命;胎盘植入(Placenta increta)是指胎盘绒毛侵入或穿透子宫肌层所致的一种异常性胎盘种植,发病机制尚不明确。那么circRNA在胎盘发育过程中的表达情况是怎样的呢?在患病孕妇和正常健康孕妇的胎盘中circRNA的表达情况又有何不同?尚未见明确报道,因此我们希望通过二代测序构建不同发育时期的胎盘circRNA表达谱,并对正常胎盘和病理胎盘circRNA进行差异表达分析,找到妊娠相关疾病的候选分子标志物。我们利用circRNA特异性建库测序,分析正常妊娠胎盘组织(早孕期人工流产,中孕期自然流产和晚孕期剖宫产)和妊娠疾病胎盘组织(子痫前期剖宫产和胎盘植入的植入部分剖宫产)中circRNA的组学特征和功能,构建了 circRNA在胎盘不同发育期间的表达谱。我们在胎盘组织中共检测到20811个circRNA,其中有7545个是胎盘组织特异性表达的;对在正常胎盘样本和子痫前期胎盘样本的差异表达circRNA进行分析,发现其中有98个circRNA在子痫前期胎盘中表达上调,423个表达下调;在正常胎盘和胎盘植入样本的差异表达分析中发现,有712个circRNA在胎盘植入胎盘样本中表达上调,98个circRNA表达下调,这些circRNA的母基因与胎盘发育等过程密切相关,提示circRNA可能通过调控胎盘发育影响了疾病发生。同时我们采用划痕实验来验证差异表达的circRNA-circPAPPA,circPAPPA2对细胞迁移能力的影响,发现circPAPPA,circPAPPA2在细胞中过表达可以增强细胞的迁移能力,这也表明了差异表达的circRNA与胎盘疾病的发生相关。此外我们还探讨了 circRNA在外周血中作为胎盘发育情况的分子标志物可能性。初步实验表明胎盘样本中差异表达的circRNA在对应的外周血样本中未检测到差异表达。
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