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本研究以贵州地方品种兴义矮脚鸡为研究对象，在形态学水平上观测并记录其体型外貌和生产性能；在细胞水平上制备染色体常规标本片，并进行G带处理，在分子水平上运用RAPD技术分析群体的遗传多样性。试验结果如下：
1、兴义矮脚公鸡羽毛以金红色为主，占群体的71.33％；母鸡以黄羽、黑羽为主，共占群体的86.32％。主导胫色是白色和青色。12周龄、40周龄公鸡体重分别为1183.95g、1890.19g；母鸡分别为927.74g、1643.66g；公鸡胫长分别为6.20cm、7.01cm；母鸡分别为5.18cm、6.03cm。成年公鸡体斜长、胸宽、胸深、胸骨长分别为22.64cm、7.31cm、10.98cm、13.24cm；母鸡分别为19.87cm、6.54cm、9.29cm、10.45cm。12周龄公鸡屠宰率、半净膛率、全净膛率、胸腿肌率分别为85.73％、78.09％、60.37％、42.22％；母鸡分别为82.71％、72.98％、59.08％、40.89％；母鸡开产日龄为165日龄，开产体重为1521.87g，开产蛋重32.32g，300日龄产蛋量为78只，平均蛋重45.47g，蛋形指数为1.35。自然交配条件下，受精率为94.76％，受精蛋孵化率91.39％，42日龄育雏成活率95.08％。
2、外周血淋巴细胞培养法适用于禽类染色体的制备，兴义矮脚鸡染色体数目2n=78，前10对为大型染色体，后29对为微小染色体。根据前10对染色体相对长度、臂比值及着丝粒指数的测量结果，各染色体的形态为：1，9号染色体及Z、w染色体为中央着丝粒(m)染色体；2、4、7号染色体为亚中央着丝粒(sm)染色体；3、6、8、10号染色体为端着丝粒(t)染色体，绘制了兴义矮脚鸡染色体核型图。详细描述了兴义矮脚鸡中期G-带带型特征，绘制了划分为34个区包括165条深浅带的G-带模式图。
3、为增强RAPD标记技术的重复性和可靠性，获得良好的扩增效果，对影响RAPD扩增体系的主要因素进行优化设置，确定反应体系为：Mg2+浓度为3.0mM，dNTP浓度为0.15mM，模板DNA用量为100ng，随机引物浓度为0.3μM，TaqDNA聚合酶为1U。反应程序为：94℃预变性6min，然后共进行42个循环，每个循环包括(94℃变性30s，36℃退火40s，72℃延伸60s)，最后72℃延伸10min。
4、对30条随机引物进行筛选，利用得到的多态性强、重复性好的13条引物对兴义矮脚鸡三品系进行RAPD分析。Y、S、B三品系分别扩增出98、100、99条带，其中多态条带数分别为60、61、65条，多态率分别为61.22％、61.00％、65.66％，平均每条引物产生的多态带分别为4.62条、4.69条、5.00条。以上结果说明，RAPD标记用于研究DNA多态性具有较高的检出率和灵敏度。
5、兴义矮脚鸡Y、S、B三品系平均条带频率分别为0.6052、0.5672、0.5661；Shannon遗传多样性指数分别为0.3400、0.3456、0.3727；品系内个体间平均遗传距离分别为0.2400、0.2453、0.2659；Y系与S系、B系间的遗传距离分别为0.2598、0.3281，B系与S系为0.3023。结果表明：兴义矮脚鸡各品系都具有较为丰富的遗传多样性，今后还有一定的选择余地。