环境影响评价机构作为我国唯一有资质接受建设单位委托为建设项目实施环境影响评价的技术服务提供者,应当秉持独立、客观且公正的态度编制环评文件,这既是环境影响评价机构作为中介组织所具有的特性使然,也是环境影响评价制度价值实现的内在要求和必然选择。然而,一个不容忽视的事实是,在实践中与环境影响评价有关的群体性事件频频发生,一些对环境产生严重不利影响的建设项目能够顺利地通过环评审批,使得环境影响评价制度形同虚设,也使环境影响评价机构能否秉持独立、客观且公正的态度编制环评文件成为公众质疑的焦点。针对这样的问题,亟需国家运用科学的环境治理制度予以规范。近些年来,国家不断深化环境影响评价制度改革,贯彻落实环境影响评价机构“红顶中介”脱钩改制政策,这对于我国环境影响评价机构独立性建设迈出坚实的一步。目前,我国对环境影响评价机构的管理是以相关政策、法律法规、规范性文件为依据,通过落实环境影响评价制度,规范环境影响评价机构行为,要求其作出高质量的环评文件,最终为环保部门作出正确决策提供依据。然而,由于环境影响评价机构迫于业务竞争的压力受建设单位意志影响、环评审批部门对建设项目环境影响评价的决定性影响、社会公众参与环境影响评价工作不到位而使监督流于形式等因素,导致环境影响评价机构的独立性在现实中面临巨大的问题与困境。面对我国环境影响评价机构独立性存在的问题与困境,在借鉴其他国家环境影响评价制度运行与机构独立工作方面先进经验的基础上,我国应当坚持以改善环境质量与绿色发展为基本出发点,并且从环境影响评价机构、环境影响评价市场、环评审批部门、公众参与制度四个维度展开治理,通过创新环境影响评价机构的委托方式、规制环境影响评价市场、强化环境影响评价机构及其工作人员的责任、规范环保部门的审批行为,完善政府问责机制、拓宽公众参与的渠道、加强社会监督等措施,来保障我国环境影响评价机构独立性建设,从而真正发挥环境影响评价制度从源头上预防与减轻环境污染的“阀门”作用,促进社会可持续发展。