学校行政部门在提高学校整体绩效方面具有重要的作用，行政部门绩效考评制度与学校行政绩效的提高息息相关，所以研究建立良好的绩效考评制度和寻找适当的绩效考评指标的方法，对学校行政部门提高办公效率和质量具有重要的意义。本文首先对目前高校绩效评价的研究现状及发展趋势进行了回顾和展望，并对高校绩效评价理论进行分析，发现目前高校绩效评价研究所存在的问题。针对高校行政部门绩效评价的问题，结合目前高校具体情况和高校绩效评价发展趋势，运用了平衡计分卡的基本思想设计了高校行政人员绩效考核指标和高校行政部门整体绩效考评指标。在实证研究过程中，将某高校行政部门的领导及工作人员作为实证研究的对象，进行问卷调查，并对问卷调查的结果进行了描述性统计分析，得出了指标重要性排序表；对调查问卷使用信度和效度检验方法，验证了问卷的有效性与真实性，说明了测量工具和问卷本身的设计合理性；通过因子分析，将相同方面中性质相近的指标加以归类，了解指标的特性，简化指标项数；利用单因子方差分析探讨领导及员工对于不同样本特征，包括是否参与决策、部门类别的不同等，在绩效考评指标的选取上，看法是否有显著差异。