遗传病的基因分析

来源 :武汉大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huawei_2009
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目的 (1)寻找单基因病痒疹样亚型单纯型大疱性表皮松解症(DM-EBS)一家系的基因突变位点。 (2)探讨对氧磷酶1(PON1)与多基因病冠心病(CHD)之间的相关性。 方法 (1)采用多聚酶链反应(PCR)、单链构象多态性(SSCP)分析、DNA直接测序方法,对DM-EBS一家系角蛋白14(K14)进行基因分析。 (2)采用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法,检测湖北地区汉族人群PON1基因启动子区-108C/T、-162A/G和-909C/G的基因型。 结果 (1)以患者DNA标本为扩增对象,在包括第一外显子在内的637bp扩增片段上,出现多个与Genebank中相同基因片段不同的碱基。 (2)在患者标本151bp扩增片段上,角蛋白14(karatin14,K14)第121密码子为CAC,与Genebank中同一位置密码子AAC不同;第123密码子为GGT,与Genebank中同一位置密码子AAT不同。其余密码子均与Genebank中同一位置密码子相同。 (3)在患者和正常对照1、正常对照2的151bp扩增片段上,患者和2例正常对照者K14第121密码子均为CAC,与Genebank中同一位置密码子AAC不同;患者K14第123密码子为AGT,2例正常对照为GGT,均与Genebank中同一位置密码子AAT不同。其余密码子均与Genebank中同一位置密码子相同。 (4)患者及其父母、祖母、正常对照3、正常对照4每份标本同时扩增二份PCR产物,扩增条件完全相同,在二份PCR产物中K14第121密码子和第123密码子有的彼此相同,有的不同。其余密码子均与Genebank中同一位置密码子相同。 (5)PON1-108C/T多态性位点:CHD组CC、TC、TT基因型频率及C、T等位基因频率分别为0.105、0.547、0.349和0.378、0.622,在健康对照组则分别为0.250、0.453、0.297和0.477、0.523,基因型分布在CHD组和对照组间存在显著性差异(p<0.05)。PoNI一162A/G多态性位点:CHn组AA、^G、GG基因型频率及^、,G等位基因频率分别为0,035、0.105、0.860和0.087、0.913,在健康对照组则分别为0.047、0.203、0.750和0.148、0.852,基因型频率和等位基因频率在两组间未见显著性差异(P>0 .05)。PoNI,9的C/G多态性位点:CHD组CC、CG、GG基因型频率及C、G等位基因频率分别为0.233、0.558、0.209和0.5 12、0.488,在健康对照组分别为0.258、0.523、0.219和0,520、0.480,两组间基因型频率和等位基因频率未见显著性差异伊>0 .05)。 (6)PONI一1 08TT基因型可能是CHD的危险因素(OR==2.807,P=0.022)。PONl一162GG基因型及PONI一909GG基因型有发生CHD的危险趋势(OR值分别为1.542和1.061),但其危险度的OR值没有统计学意义(OR值分别为0.550和0 .887)。 (7)把PONI三个多态性位点一2 08C厅、一62AjG和一909C/G对CHD的危险性作联合分析,有一个危险基因型个体的O卜1名12,P=0.244;有两个危险基因型个体的OR=l.636,P=O、360;有三个危险基因型个体的O卜3.556,P=0.079,均无统计学意义。 (8) CHD组血浆HDL一C和APoAI水平明显低于对照组(P<0.05),而血浆TG、TC和LDL一C水平在CHD组和对照组间无显著性差异伊>0.05)。在PONI一108C汀多态性位点,CHD组CC基因型血浆HDL一C水平明显低于对照组(P<0.05),TC、TT基因型血浆HDL一C水平在两组间无统计学差异(P>.05)。PONI一162刀G和PONI一909OG多态性位点不同基因型亚组间血脂水平没有明显差异伊>0 .05)。 结论 (1)角蛋白K14第121密码子和第123密码子可能存在基因多态性。 (2)该家系在角蛋白K14 IA区151bp基因片段不存在基因突变。 (3)PONI一108C汀基因多态性与中国人群CHD相关。 (4)P ONI一162刀G和PONI一909C/G基因多态性与中国人群CHD无关联。 (5)PONI一IOSTT基因型可能是CHD的危险因素。 (6)PONz一2 osC汀、pONI一1 62刀G和poNI一gogC/G基因多态性对CHD的影响无协同性。
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