组蛋白修饰在两细胞系上的分布分析

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基因组表达调控是一个非常复杂的过程,除了DNA自身序列的调控作用外,还受到很多表观遗传修饰的调控作用。近年来,人们逐渐发现表观遗传学的重要性及其在医学领域上的应用。组蛋白修饰是表观遗传学研究的一个重要方面,具有重要的理论意义和应用前景,而关于细胞分化的表观遗传学调控和启动子、增强子上的组蛋白修饰分析已成为新的研究热点。本文对人类两个时期细胞系的组蛋白修饰的变化情况进行了分析研究。  首先,利用H1(人类胚胎干细胞)和IMR90(人类胚肺成纤维细胞)这两种细胞系的H3K9me3、H3K9ac、H3K4me1、H3K4me3、H3K27ac、H3K27me3、H3K36me3七种组蛋白修饰的ChIP-seq数据,分析了两种细胞系中的各种组蛋白修饰分布密度,计算了分布的相关性。  其次,计算了不同功能区(外显子、内含子、启动子)各类组蛋白修饰间的相关性,进一步讨论了在H1和IMR90两个细胞系上的组蛋白修饰的变化,为了解组蛋白修饰在细胞生长、分化过程中的重要作用提供了一定的基础。  最后,分析了在三个功能区域中组蛋白修饰的分布,进一步了解在两个细胞系中不同功能区域七种组蛋白修饰的分布特征,有助于理解组蛋白修饰的功能。
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