【摘 要】
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微生物菌群结构对宿主营养的摄入、疾病的发生、免疫力的调节等方面的作用已被学术界广泛认可,并成为近十年来的研究热点。爬行动物是动物系统演化史上不可替代的环节,但近十年来肠道微生物多样性的研究主要集中在其他脊椎动物,爬行动物中陆龟的相关研究更是少之又少。本研究以世界第三大陆龟的苏卡达陆龟作为实验动物,分别采集不同年龄、改变饮食的苏卡达陆龟的粪便样本,采用高通量测序技术进行测序、比较和分析。旨在探究不同
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微生物菌群结构对宿主营养的摄入、疾病的发生、免疫力的调节等方面的作用已被学术界广泛认可,并成为近十年来的研究热点。爬行动物是动物系统演化史上不可替代的环节,但近十年来肠道微生物多样性的研究主要集中在其他脊椎动物,爬行动物中陆龟的相关研究更是少之又少。本研究以世界第三大陆龟的苏卡达陆龟作为实验动物,分别采集不同年龄、改变饮食的苏卡达陆龟的粪便样本,采用高通量测序技术进行测序、比较和分析。旨在探究不同年龄之间、饮食变化后苏卡达陆龟粪便微生物菌群多样性结构的变化,探究其可能的原因,尝试分析并确定苏卡达陆龟的核心菌群。探究不同年龄对苏卡达陆龟粪便微生物组成的影响实验中,代表群落多样性的Shannon和Simpson指数随年龄递增。粪便中厚壁菌门、厚壁菌门与拟杆菌门的比值（F/B）、螺旋体门、密螺旋体属、梭菌属、八叠球菌属、瘤胃球菌属等相对丰度依年龄递增,拟杆菌门、变形菌门、疣微菌门、氨基酸球菌属、Parabacteroides菌属等相对丰度依年龄递减,且其中多个菌群在幼年体（A）、亚成体Ⅱ（C）组间存在显著差异（P＜0.05）。NMDS分析结果显示与亚成体（B、C）两组相比,幼年体（A）明显分离在一侧且样本更加聚集。以上均说明苏卡达陆龟生理状态随着年龄的增长逐步发生变化,进而影响肠道菌群组成。探究改变饮食对于苏卡达陆龟粪便微生物组成的影响实验中,在代表群落丰富度的Chao I指数上,更换食物的第5天（D1）和第10天（D2）与第40天（D4）和第55天（D5）间均呈现显著性差异（P＜0.05）,但第25天（D3）与前后均无显著性差异。厚壁菌门、拟杆菌门、互养菌门、瘤胃球菌属、密螺旋体属、梭菌属等在D1组相对丰度即发生急剧变化,与对照组（B5）相比最多可增加（降低）5倍左右;变形菌门、螺旋体门、瘤胃球菌属、Blvii28菌属、颤螺旋菌属等在D3时相对丰度存在明显波动（高于/低于前后组）;螺旋体门、瘤胃球菌属、密螺旋体属等在D4、D5组相对丰度相似且与B5、D1组有显著变化。PCo A分析显示D1组组内差异性剧增,自D3组开始组内个体差异性有所回落且与后两组有明显分离,D4、D5两组与其他组存在较明显的分离现象。综上所述,苏卡达陆龟肠道菌群对食物组分的变化有着快速的响应能力,在改变饮食25天后肠道菌群存在“节点”,而后在D4、D5时期初步形成了一个新的动态平衡。
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