辛纳毒蛋白的提纯,结晶以及结构分析Lcn6蛋白及其衍生物的表达,复性及结晶

来源 :中国科学院大学(中国科学院上海生命科学研究院) | 被引量 : 0次 | 上传用户:Heavenws
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本论文包括两个部分:第一部分辛纳毒蛋白的提纯,结晶以及结构分析辛纳毒蛋白是从香樟树种子中提取的一种II型核糖体失活蛋白(ribosome inactivating protein, RIP)。它的A-chain是一种N-糖苷酶(rRNA N-糖苷酶,EC3.2.2.22),能专一地切去核糖体大亚基28S rRNA的Sarcin/Ricin结构中的一个腺嘌呤,从而阻抑延伸因子与核糖体的结合,导致核糖体不能进行蛋白质合成。与蓖麻子毒蛋白一样,辛纳毒蛋白也是一种在种子中高含量的Ⅱ型RIP,但与高毒性的蓖麻毒蛋白不同,完整的辛纳毒蛋白是低毒性,尽管它们氨基酸序列的同源性很高。我们通过改变提纯的方法,利用FPLC不仅缩短了提纯目的蛋白所用时间,而且提高了最终蛋白的纯度,然后经过结晶条件的筛选,得到了蛋白晶体。晶体经过X-ray衍射分析,收集了衍射数据。数据经过处理后,以蓖麻子毒蛋白为起始模型,采用分子置换,最终在2.95 ?确定其结构,结构的Rfactor是25.6%,Rfree是29.7%。并对其结构跟蓖麻子毒蛋白和相思豆毒蛋白的结构进行了比较分析。与蓖麻子毒蛋白以及相思豆毒蛋白等其它的II型RIP相比,在AB链之间相互作用上存在比较大的差别;我们还发现了它们在一个可能是核糖体RNA结合位点上有着较大差别;并且在辛纳毒蛋白晶体结构的活性中心部位发现了一个的非共价结合的腺嘌呤。值得注意的是,在纯化与结晶的过程中没有任何腺嘌呤以及其衍生物都被添加,因此该腺嘌呤很可能是一个酶促反应后的产物。第二部分Lcn6蛋白以及其Se-Met衍生物的表达,包涵体纯化,复性以及结晶。Lcn6蛋白是Lipocalin家族中新发现的一个蛋白。该家族的蛋白在高等动物中普遍存在,且种族间序列的同源性比较小。而Lcn6蛋白与Lipocalin家族的其它蛋白相比,一级结构的同源性也较小,但与已被证明有重要功能的Lcn5与Lcn8的同源性比较高,后两者最近已有证据显示它们跟精子的成熟有关。免疫荧光印迹表明Lcn6主要集中表达在精子的头部与尾部。目前的证据表明,Lcn6蛋白很可能与某个蛋白结合,以复合物的形式,参与了精子成熟的过程。我们实验室在大肠杆菌中表达了该蛋白,发现该蛋白表达为包涵体。我们系统研究了该蛋白包涵体纯化,变性以及复性的方法,并经过结晶条件的筛选,成功地得到了蛋白晶体,并在同步辐射中心收集到了数据。在结晶条件的筛选过程中,我们根据蛋白的可结晶性原理,设计了理性筛选结晶条件的方法,迅速地得到并优化了蛋白晶体。并且将纯化,复性以及结晶条件筛选的方法应用在Lcn6的硒代衍生物上,也成功地纯化、复性了该蛋白,并且在相似的结晶条件下得到了晶体,同样在同步辐射中心成功收到完整的数据。目前结构用SAD(Single Wavelength Anomalous Diffraction)解决了相位,结构在分辨率为1.90 ?确定下来,结构分析正在进行当中。
其他文献
本论文分为两个部分,共六章,第一部分主要工作为染色体大片段的遗传操作,其中包括三章,第一章为应用Cre-LoxP系统在细胞内原位套取染色体大片段;第二章为用TAR((transformation-associate recombination)建立hIGH基因YAC文库;第三章为文献综述;第二部分主要讨论siRNA作用靶点的筛选和shRNA的转录调控,也分为三章,第四章为体外无细胞系统快速有效地筛
第I部分:FGF信号通路与P19细胞神经命运决定多潜能的小鼠P19胚胎性癌细胞经视磺酸(retinoic acid, RA)诱导,同时形成细胞团,可以分化为神经元和神经胶质细胞。免疫染色显示在RA诱导4天后形成的细胞团中,P19细胞表达神经干细胞特异的标记分子nestin和Sox。这些P19神经干细胞在细胞团内排列成类似神经管的rosette结构,提示RA诱导的P19细胞神经分化过程经过神经干细胞
拟南芥ASYMMETRIC LEAVES2 (AS2)基因在叶发育过程中起到调节近轴面极性建成的作用。由PHABULOSA (PHB)、PHAVOLUTA (PHV)和REVOLUTA (REV)组成的PHAB基因家族、AS1和AS2共同作用于近轴面极性建成。KANADI (KAN)和YABBY (YAB)基因在远轴面极性建成中起作用。现在已知这些基因共同作用于叶片的近-远轴极性建成,但是AS2同
盐藻(Dunaliella salina)是一种无细胞壁的单细胞真核绿藻,可以用作研究植物细胞对胁迫反应的模式生物,也具有重要的生物工程应用价值。盐藻的遗传转化是对盐藻进行分子遗传学研究的必需技术。本论文介绍了解决这一问题的主要研究工作:(1)、研究盐藻电击转化中电场强度对细胞存活和外源DNA导入效率的影响,确定了盐藻电击转化的基本参数;把含有ble基因的质粒通过电击转化导入盐藻细胞,检测到ble
已有的大量文献表明,脂质筏和质膜微囊(统称为脂质微区)在不同的跨膜信号通路中都起到十分重要的作用。此前本实验室的研究也证明:在3T3-L1前脂肪细胞分化过程中,脂质筏/质膜微囊在类胰岛素样生长因子1(Insulin-like growth factor-1,IGF-1)受体的信号转导过程中起着重要的作用。但是,已有的研究结果尚不能确切界定究竟是脂质筏亦或是质膜微囊在此过程中起决定性的作用。为此,我
神经元的电活动能对皮层神经元环路中兴奋性突触传递效率进行长时程修饰。本文中我们报告这种长时程突触可塑性具有靶细胞类型依赖的特性。在大鼠体感皮层(somatosensory cortex)第二/三层(layer 2/3),锥体细胞(pyramidal cell,PC)可同时在快速放电(fast spiking,FS)和低阈值放电(low-threshold spiking,LTS)中间神经元上形成突
本论文利用高压力技术、荧光光谱学等多种方法研究了菠菜光合作用系统II外周蛋白—23kD蛋白(以P23k表示)以及重组猪胰岛素前体(以rPIP表示)的折叠/解折叠。在P23k的研究中,我们用高压力技术结合荧光光谱学等方法在不同的实验条件下系统地研究了P23k折叠/解折叠。热力学研究表明,该蛋白质对压力非常敏感,极易被高压力解折叠。在20℃,pH 5.5的条件下,180MPa即可使该蛋白质完全解折叠,
清初著名评点家金圣叹指出《水浒传》所写梁山一百零八人"于宋江特依世家例",这一粗线条的观点体现出他对《水浒传》创作技法与叙事成就的理解,同时也体现出其对《史记》体例的认识、对《史记》叙事成就的独到见解。解读这一观点,应立足《水浒传》宋江其人其事,以《史记》的叙事成就为参照,尤其以《史记》"世家"的叙事成就为参考,从《史记》的叙事体例、"爱奇"的叙事风格、《史记》中蕴含的叙事智慧等方面入手,系统分析
《水浒传》一书,以人物形象的塑造见长。金圣叹称赞其"写一百八个人性格,真是一百八样"。据统计,《水浒传》整本书中,有名有姓的人物有577人,加上其他有姓无名、有名无姓、无名无姓但推动情节发展的人物,总计达827人。这些人,有皇族贵胄、豪富将吏,也有猎户渔人、屠夫刽子手,三教九流。作者用手中妙笔,同中见异地写出了他们的个性。我们今天就来聊一聊,《水浒传》是如何成功塑造人物形象的。
期刊
人类巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)的感染对人类健康造成严重威胁。HCMV几乎可以感染所有器官,它的感染一方面使细胞吞噬溶解功能、抗原呈递功能、分泌抗病毒细胞因子和调节因子的功能显著降低;另一方面通过抑制Th功能或下调感染细胞MHC—I类抗原表达,使被感染个体免疫功能下降。在感染发生过程中极早期启动子(major immediate early enhancer/