神经系统是人体的重要调节机构，它与内分泌系统、感觉器官一起，完成对人体各系统、器官机能的调节和控制，从而使人体保持内外环境的平衡。神经外科手术主要指用外科手术的手段来治疗神经系统方面的疾病，治疗的效果显著，尤其是微创神经外科手术，其优点更加明显。 手术规划是指在实际的手术治疗以前，通过对病人进行一系列的影像诊断，得到病人相应部位的医学断层图像。然后通过多种处理手段，得到病人的二维增强图像和三维重建图像。医生可以通过该二维或三维图像直观的观察到病人病患部位的一些重要的、不易被直接观察到的信息，并且通过计算机的模拟，医生可以在假设治疗路径的情况下观看到此治疗路径对病人身体的影响，从而可以杜绝隐患，得到最佳的治疗路径。手术规划是指在实际的手术治疗过程中，医生能够动态的获得手术中的当前状况。通过红外定位体统对病人以及手术器械的注册与定位，病人与手术器械的三维重建结果可以和实际的物理空间的结果相吻合，从而使实际的任何操作都可以实时的在计算机中显示出来，其可以达到肉眼所不能及的许多部位。 本文旨在实现一个基于OPENGL的手术规划与手术导航系统。系统主要由图像输入、二维图像处理、三维图像重建以及三维实时导航这四个模块构成，能够基本完成从图像获取到最终导航的一个基本流程，其具体效果还有待于与相关生物实验结合的研究。