基因表达谱在慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌进程中的应用研究

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qsczsr15
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
胰腺癌是全球癌症死亡的第七大主要原因,发病率呈上升趋势。胰腺癌早期缺乏特异性的症状,通常被确诊时已经进入中晚期,且大部分已发生转移扩散。急需研发能够进行早期诊断的生物标志物和有效的靶向药物。胰腺炎和胰腺癌在诊断中容易混淆,胰腺炎相关基因在胰腺癌进展中的表达及其临床意义,仍有待进一步阐明。本文利用转录组学数据,研究慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌转录网络机制,提供了系统水平的新颖的分子标记物和药物靶标。本研究采用疾病表型→全基因组表达谱→差异表达基因→富集分析→网络构建→网络分析→候选基因→验证的策略:利用慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌的全基因组表达谱,确定差异表达基因,进行富集分析;利用慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌的共性差异表达基因和特性差异表达基因,分别构建网络,分析网络的枢纽节点和关键模块,确定关键候选基因;利用临床病人的数据进行验证。在全基因组水平,确定网络关键分子与慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌的关联,多视角阐释和理解胰腺疾病恶性转化的分子机制。目的:探讨慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌在转录组上的相关性,明确慢性胰腺炎相关基因与胰腺癌和转移胰腺癌病理特征之间的关系,为胰腺癌患者的诊断和预后判定提供依据。方法:利用欧洲生物信息学研究所数据库的人胰腺样品的基因表达谱(包括9例正常胰腺样品、9例慢性胰腺炎患者样品、9例胰腺癌患者样品和9例转移性胰腺癌患者样品)进行聚类分析、差异表达基因筛选(使用倍数变化|log2Fold Change|>1,错误发现率FDR<0.05为阈值)、功能富集分析、生物分子网络构建、网络拓扑学分析,确定候选基因;采用The Human Protein Atlas数据库及GEPIA数据库证实候选基因的表达水平对胰腺癌患者的预后评估价值。结果:1.与正常胰腺相比,差异表达基因(differential expressed genes,DEG)在慢性胰腺炎中有965个,胰腺癌中有2060个,而转移性胰腺癌中有2517个;慢性胰腺炎和胰腺癌有741个重合,占胰腺癌DEG的35.97%;胰腺癌和转移胰腺癌有1315个DEG重合,占转移胰腺癌DEG的52.24%;慢性胰腺炎和转移胰腺癌有656个DEG重合,占转移胰腺癌DEG的31.84%;慢性胰腺炎、胰腺癌和转移胰腺癌之间,573个DEG重合。提示通过基因芯片显著性分析(significance analysis of microarrays,SAM)方法,确定了正常状态、慢性胰腺炎、胰腺癌和转移性胰腺癌四个阶段中,都发生差异表达的302个有统计学意义的DEG。2.IL6、FN1、ALB、PTPRC、CXCL8、VCAM1、TIMP1、ACTB、ITGB2、COL1A1、FYN、RAC2、CXCL8和PTGS2在慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌进程中起关键作用。3.通过The Human Protein Atlas数据库和GEPIA数据库分析发现,FYN高表达的胰腺癌患者的总生存期明显长于FYN低表达的胰腺癌患者(P<0.05)。结论:1.慢性胰腺炎、胰腺癌和转移胰腺癌之间存在相关性。2.蛋白质代谢、能量通路和核糖体生物合成在慢性胰腺炎-胰腺癌-转移胰腺癌组织中表达水平有显著变化。3.FYN蛋白的表达水平越高,胰腺癌患者的预后越好。FYN蛋白有望成为胰腺癌早期诊断及预后判定的生物标志物。
其他文献
目的:C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)是一种常见的炎性指标,对于感染及多种结缔组织病的鉴别、判断病情严重程度或活动性等有重要意义。因测定敏感度的提高,超敏C反应蛋
在神经网络、生态系统、传染病模型、电力系统、经济运行系统等动态演化过程中,普遍存在着时滞现象,而且不少时滞效应是时变的且长期有效(即无界时滞).另外,由于外部环境干扰,系统状态还可能受到随机噪声和脉冲效应的影响.因而具有无界时滞、甚至包含随机和脉冲效应的泛函微分方程描述的数学模型在一些场合应更符合实际意义.鉴于此,本文主要研究几类具有无界时滞、以及包含脉冲和随机效应的泛函微分方程的渐近性行为,包括
钙钛矿太阳能电池具有制备工艺简单、生产成本低、可柔性制备等诸多优点,成为下一代最有具应用前景的光伏器件之一。自2009年起,钙钛矿太阳能电池的光电转换效率(PCE)已经从最初的3.8%提升到25.2%。然而,尽管效率已经接近商业化标准,钙钛矿材料中包含的铅元素仍然限制了其大规模商业化应用。因此寻找可替代的非铅钙钛矿材料迫在眉睫。这其中,锡(Sn)基钙钛矿因具有与铅(Pb)基钙钛矿相似的离子半径、消
目的:通过回顾性研究炎症因子在阻塞性睡眠呼吸暂停综合征(OSAS)及其合并高血压患者中的水平,分析OSAS及其合并高血压与炎症反应的关系,探讨炎症因子与OSAS合并高血压疾病严重程度的相关性。方法:选取2017年10月至2018年12月期间就诊于吉林大学第一医院的患者共90例,并根据多导睡眠图(PSG)和动态血压监测结果,将其划分为OSAS合并高血压组(病例数n=30),仅患有OSAS组(n=30
国家的发展离不开教育,教育的发展离不开教师。小学语文是基础教育阶段的基础学科,这一教育阶段的关键人物在于教师。由此可见,促进教师专业发展非常有必要,这也是我国教育事业研究的重点。本文借鉴前人关于小学语文教师专业发展的研究维度,包括专业理念与师德、专业知识、专业能力三个维度进行分析:专业理念与师德中包含职业道德素养、教育理念、自我发展意识;专业知识中包含语文学科知识、教育理论知识、通识性知识;专业能
罗洪先为江右王学的代表人物之一,在明代三教合一的时代背景下,调息静坐为儒家所引用而大放异彩。罗洪先调息静坐吸收了宋明以来的儒家学者的经验,同时吸收了道家和佛家的调息静坐的实践,从而形成其独特养生的思想理论。因此,若能从罗洪先的静坐实践与哲学思想中吸取养生思想,对于养生学的发展具有重要意义。本文将罗洪先调息静坐思想概括为以下几点:一,讲述罗洪先的生平包括中举出仕、归乡寄情于山水、致力于乡族建设、讲学
智能复合材料补片修理技术是一种具有嵌入式感受机构的修理技术,即通过将应变、压电或光纤等传感器嵌在复合材料补片内部的方式实现智能复合材料补片。该技术方法能够实现金
轮廓检测是机器视觉、目标识别等领域的基本且重要的任务之一。轮廓检测不同于传统的边缘检测,它抑制了背景纹理等没有意义的边缘,突出了目标物体的边缘,是对边缘检测的一种
戏谑作为一种从古至今的写作手法,在长期的文化积淀中生长出丰富的内涵。其立足在现实的基础之上,用笑谑艺术形式对现实人生进行层次不同的批评与揭露。称得上是一种连接个体主客观感受,个人情感的感性与理性,个性发展中现实与内在冲突的媒介。作为一种特殊的文学审美表现形式,清末民初短篇小说中的戏谑,以狂欢的姿态、含泪式的笑,展示着时代特质下的社会生活与人情冷暖。本文立足清末民初短篇小说创作中的戏谑化书写,在对戏
由于液体受外部激励作用表现出的非线性特征,使得液体晃动力学分析对于液罐车系统流-固耦合问题的研究而言有着十分关键的作用。本课题首先通过计算流体力学软件对液罐车罐内液体纵向晃动的现象和特征进行比较分析。在此基础上,基于等效机械模型方法,通过计算流体力学仿真分析的结果,利用遗传算法求解了模型的结构参数,建立了用于预测罐内液体纵向晃动的等效模型。通过对比模型结果以及仿真实验数据,对等效机械模型优化和改进