鸡蛋清溶菌酶（HEWL）是一种水溶性好且内部结构稳定的蛋白酶，实验结果表明它对碳纳米管（CNTs）有较好的分散作用。本分运用分子动力学的方法模拟了水溶液中HEWL在碳纳米管表面的吸附行为。选取了HEWL中暴露在外表面的六个疏水位点正对碳纳米管在300K的温度条件下分别进行了50纳秒的计算机模拟。在所选取的六个取向中都发生了吸附，在吸附过程中HEWL面向碳纳米管的氨基酸残基会向更为柔性的结构转变，以增大蛋白质在碳纳米管表面的覆盖率。在50纳秒的模拟时间内，HEWL和碳纳米管间的相互作用能随时间的延长而增加，但这种能量递增是呈阶段性而非线性的。这表明HEWL在CNTs表面的吸附是逐步进行的，在跨越一定的能量障碍后HEWL中的部分残基才会渐渐向CNTs移近，最后达到吸附平衡。从模拟结果来看，由初始吸附到到达吸附平衡态这中间的过程是比较漫长的，这就中间需要更长时间的模拟。为了研究在碳管表面的吸附是否会影响HEWL的催化活性，我们在模拟体系中加入了底物糖分子MGM。模拟结果表明底物中两端糖环与蛋白残基的作用对中间糖环的固定十分重要，HEWL活性部位残基与碳管间的作用比与与底物间的作用要强，因此在固定化过程中应避免活性部位残基距碳纳米管表面太近。当活性部位残基不在碳管表面的吸附距离范围内时，吸附态的HEWL与底物分子间的作用相比于游离态稳定性更强。有实验结果表明，HEWL对碳纳米的分散作用与超声过程中的温度升高有密切关系。本文选取了50℃，70℃，80℃和90℃分别进行了50纳秒的模拟。模拟结果表明，温度升高能缩短HEWL在碳纳米管表面达到吸附平衡态的时间，温度升高后HEWL内部的二级结构有部分解折叠。在解折叠过程中，溶菌酶分子结构中的疏水中心-“Hydrophobic box‖会快速移向碳纳米管表面，以增强两者间的吸附作用。