MYP10和MYP15区域多态性位点与中国汉族人群高度近视的相关性分析

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高度近视是一种比较常见的眼科疾病,其病因比较复杂,遗传因素和环境因素共同作用于近视的发生和发展,遗憾的是目前高度近视发病机制尚不完全清楚。本研究主要探讨染色体8p23(MYP10)和10q21.1(MYP15)区域单核苷酸多态性位点与中国汉族人群高度近视的关联性,为揭示高度近视遗传学发病机制提供良好的依据。采用病例对照研究,收集中国西南地区高度近视患者静脉血液样本869例和与之地区,年龄以及性别相匹配的正常对照804例。研究通过了电子科技大学附属医院.四川省人民医院伦理委员会的审查。应用Snapshot单碱基延伸的方法,对MYP10区域上的8个(rs189798,rs9949,rs19334,rs4840437,rs6989782,rs656319,rs6983332和rs12678938)和MYP15区域上的4个(rs1394108,rs4589208,rs11005665和rs10825992)单核苷酸多态性位点进行基因分型,哈迪-温伯格Hardy–Weinberg平衡检测基因型分布,验证研究中选取的人群样本是否可以代表群体。利用卡方检验比较高度近视病例组和正常对照组之间等位基因及基因型频率分布是否有显著的统计学差异,同时所有的关联分析都经过校正性别和年龄的二元逻辑回归分析。Haploview4.2软件分析连锁不平衡区块和基于连锁不平衡的单体型分析。SPSS17.0软件对上述所有的统计结果进行分析与处理。研究结果显示12个SNPs位点均符合哈迪-温伯格平衡(P>0.001)。其中,TNKS基因上的rs4840437和rs6989782位点等位基因频率分布在病例和对照组之间具有显著的统计学差异(P=0.004;P=0.004)。遗憾的是,校正性别和年龄后,在高度近视病例组和正常对照组中,纳入的12个单核苷酸多态性位点的等位基因频率分布在统计学均显示无显著的差异(P>0.05)。不同的遗传模型分析表明,与携带rs6989782CC基因型的个体比较,携带rs6989782CT和rs6989782TT+CT基因型的个体高度近视患病率会降低(杂合模型:P=0.023,OR=0.752,95%CI=0.588-0.962;P=0.014,OR=0.116,95%CI=0.021-0.647;显性模型:P=0.033,OR=0.776,95%CI=0.614-0.979;P=0.014,OR=0.116,95%CI=0.021-0.647)。单体型分析结果显示TNKS基因上的rs4840437和rs6989782两个位点存在于同一个连锁不平衡结构区(LD),包含三种单体型(AC,GT和GC),其中AC(P=0.002)和GT(P=0.027)单倍体型在病例组和对照组中单体型频率差异具有显著的统计学意义。综上可知,TNKS基因上单核苷酸多态性位点rs4840437和rs6989782与中国汉族高度近视人群具有显著的相关性,提示位于MYP10区域上的TNKS基因与中国汉族人群高度近视的发生发展具有重要的关联性,后续我们将进行更多功能性研究验证我们的研究结果。
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