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猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是近十多年来对我国生猪产业危害严重的动物疾病,其病原猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的传染性较强,可导致母猪繁殖障碍以及仔猪和育肥猪严重的呼吸系统疾病。在外界环境和免疫压力下容易发生变异,不同PRRSV变异株其基因组遗传特性和致病性也不尽相同,及时监测PRRSV分离株遗传变异特征,可为指导PRRSV科学防控策略的制定和有效疫苗的研制提供有益帮助。本研究中我们首先对566份发病猪临床样品进行了PRRSV检测,结果发现其中246份样品呈PRRSV阳性。选择其中部分阳性样品的Nsp9、Nsp2和ORF5基因进行序列分析。结果显示:在PRRSV阳性样品中,18株ORF5基因主要分布于L1、L3和L8三个谱系中;28株毒株Nsp2基因主要分布于L1、L5和L8三个谱系中;10株Nsp9基因分布于L1和L8两个谱系中。氨基酸序列分析结果显示,不同毒株间Nsp2基因存在4种不同的氨基酸缺失模式,即:1+29 aa,111+1+19 aa,111+5+1+19 aa,1+29+14 aa。其中SHpd1/2018株Nsp2与NADC30株类似,存在131 aa缺失,而HBap4/2018株在此基础上,又新增加5 aa缺失的特征。其中,值得关注的是HBap4/2018和SHpd1/2018株,来自相同毒株的Nsp2和ORF5基因却分别属于不同基因亚群,我们推测这两个毒株其基因组可能发生了重组。为了分析HBap4/2018和SHpd1/2018毒株的特性,我们成功分离获到了这两株病毒,鉴定结果显示两株病毒均可被针对PRRSV HuN4株GP5和N蛋白单抗特异性识别,但HBap4/2018株和SHpd1/2018株却不被针对HuN4株Nsp2蛋白特异性单抗所识别。两株病毒在Marc-145细胞的增殖特点和噬斑形态与HuN4株基本类似。重组分析结果表明,两个毒株都是由HP-PRRSV-like毒株(主要亲本毒株)和NADC30-like毒株(次要亲本毒株)重组而来,但是其重组模式却不相同,其中SHpd1/2018株存在2个重组位点(2002 nt和3205nt),均位于Nsp2基因的高变区内。而HBap4/2018株存在5个重组断点(2000 nt、5105 nt、6292 nt、7412 nt和14249 nt),分别位于Nsp2、Nsp3、Nsp5、Nsp7和ORF7基因区域,属于一种新的PRRSV自然重组突变毒株。为了弄清PRRSV新型重组突变毒HBap4/2018株的致病特征,我们将HBap4/2018株感染30日龄的试验仔猪,通过对仔猪攻毒后的临床症状、血清中病毒载量、鼻拭子排毒以及组织病理学观察等检测指标,对其致病性进行了评价,结果显示:HBap4/2018株感染可使试验仔猪100%发病,主要表现持续高热、呼吸障碍、厌食和精神沉郁等典型临床症状;并且在感染后第4、15和28天各有1头仔猪死亡,死亡率达60%,通过本研究证实我们分离获得的新型重组变异毒株HBap4/2018对仔猪的致病性较强。本研究分析了近年来我国部分地区PRRSV流行毒株的遗传变异特征,分离获得了具有新的遗传特征的PRRSV自然重组毒株,该PRRSV重组变异株保留了与HP-PRRSV毒株毒力相关基因的遗传特征和生物学特性。并证实新出现的自然重组毒HBap4/2018株对仔猪致病性较强。研究结果将有助于深入了解我国PRRSV流行毒株的遗传变异特征和致病特点,为PRRSV科学防控策略的制定和新型疫苗的研制提供了新的参考依据。