miR-138-5p与甲状腺乳头状癌超声二维声像图特征相关性及其潜在分子调控机制的研究

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第一部分miR-138-5p与甲状腺乳头状癌超声二维声像图特征相关性的研究目的:研究甲状腺乳头状癌(Papillary Thyroid Carcinoma,PTC)中miR-138-5p表达规律与超声二维声像图特征的相关性。方法:1.分析总结纳入实验的24例PTC病例、23例良性病例的超声二维声像图特征,包括数目、内部回声、大小、边缘、纵横比、钙化、有无突破甲状腺被膜。2.应用实时荧光定量聚合酶链式反应(Quantitative Real-time PCR,RT-qPCR)检测24例甲状腺乳头状癌及23例甲状腺良性组织(包括结节性甲状腺肿、腺瘤或腺瘤样增生)中miR-138-5p的表达水平,独立样本t检验比较实验组和对照组样本中miR-138-5p的表达水平。3.Fisher确切概率法分析各二维超声图像特征与miR-138-5p表达规律的相关性。结果:1.实验组纳入病例的二维超声图像主要表现为低回声91.7%(22/24)、边缘不规则83.3%(20/24)、纵横比≥1 75%(18/24)、微钙化58.3%(14/24)以及病灶突破甲状腺被膜75%(18/24);而对照组良性患者二维声像图特征明显与边缘不规则1.7%(4/23)、纵横比≥1(0/23)、微钙化(0/23)、病灶突破甲状腺被膜(0/23)无明显关系。2.本部分研究对纳入研究的24例PTC病例和23例良性病例的术后组织标本行RT-qPCR实验,结果表明mi R-138-5p在PTC中的表达水平明显低于甲状腺良性组织,差异有显著性(P<0.0001)。3.甲状腺乳头状癌声像图特征中边界不规则、纵横比≥1与miR-138-5p低表达相关,差异有统计学意义(P<0.05)。其他声像图特征,包括结节内部实性低回声、伴微钙化、突破甲状腺被膜等与miR-138-5p低表达不相关。结论:本部分研究结表明甲状腺乳头状癌声像图特征中边缘不规则、纵横比≥1与miR-138-5p低表达存在一定的相关性,这可能对PTC的早期术前诊断有帮助。第二部分mi R-138-5p在甲状腺乳头状癌的表达及潜在分子调控机制的研究目的:第一部分的研究的结果表明甲状腺乳头状癌的二维超声特征边缘不规则和纵横比≥1与mi R-138-5p低表达有关,而边缘不规则和纵横比≥1是甲状腺乳头状癌的恶性征象,在本部分研究中,目的是从大数据库挖掘mi R-138-5p的表达数据,探究mi R-138-5p在PTC中的潜在分子调控机制及其临床价值。方法:在基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取mi R-138-5p的表达数据,包括586例甲状腺癌组织和114例非癌组织,独立样本t检验比较GEO和TCGA数据库中mi R-138-5p在甲状腺癌组织和非癌组织中的表达差异。此外,还在TCGA数据库下载PTC的临床病理参数信息,应用卡方检验对PTC的临床病理参数与mi R-138-5p表达规律之间的相关性进行检测。对从GEO和TCGA获得的数据应用STATA软件进行meta分析,对连续变量采用标化均数差(Standardised mean difference,SMD)及其95%可行区间(95%CI)分析,并绘制SROC估计曲线下面积(Area Under the Curve,AUC)。通过12个mi RNA-m RNA基因预测网站得到了mi R-138-5p潜在的靶基因,应用DAVID在线软件分析mi R-138-5p的245个潜在靶基因,得到GO注释和KEGG通路,应用生物信息学方法分析mi R-138-5p在PTC的潜在分子机制。结果:GEO和TCGA数据库证实mi R-138-5p在PTC的表达明显低于非癌组织(P<0.05)。分析TCGA数据库中mi R-138-5p表达规律与PTC患者临床病理参数之间的关系,发现其在伴淋巴结转移组中低表达所占比率(54.0%)明显高于无淋巴结转移组(45.0%)(P=0.044)。此外,meta分析结果显示SROC的曲线下面积(AUC)为0.9249,mi R-138-5p的合并敏感度为0.91(95%CI:0.89-0.94),合并特异度为0.85(95%CI:0.77-0.91),合并阳性似然比(PLR)为4.71(95%CI:3.11-7.16),合并阴性似然比(NLR)为0.17(95%CI:0.04-0.61),合并总诊断比值比(DOR)为37.91(95%CI:15.27-94.10),表明mi R-138-5p在检测PTC方面可以提供较高的诊断效能。通过mi RNA-m RNA预测网站得到的靶基因进行GO注释和KEGG富集分析,GO基因注释中潜在靶基因除了参与肾脏和神经发育外,也参与细胞运动和移行(P<0.05)。KEGG通路分析表明mi R-138-5p的潜在靶基因主要富集在癌症通路上。通过PPI和KEGG,我们得到两个中心基因(ITGA3和LAMC2),ITGA3和LAMC2在PTC组织呈明显高表达,与非PTC组织相比差异有统计学意义(P<0.0001)。mi R-138-5p与ITGA3(r=-0.2289;P<0.0001)和LAMC2(r=-0.1020;P=0.0224)呈显著负相关。结论:本部分研究证明了mi R-138-5p在PTC中呈显著低表达,还明确了mi R-138-5p在PTC中的临床意义。除此之外,mi R-138-5p对于检测PTC具有较高的诊断价值,而且可能通过调控相关靶基因(如ITGA3和LAMC2)参与PTC发生发展过程。本部分研究所获得的结果可为PTC的术前诊断和治疗提供新的视角。
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