猪链球菌2型强、无毒毒株定量分泌蛋白组学研究

来源 :贵州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiangjiao610329
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]:  本文通过蛋白组学方法比较猪链球菌2型(Streptococcussuisserotype2,SS2)强、无毒株分泌蛋白,分析二者蛋白表达的差异,以期进一步了解SS2的致病机制明确该菌株间致病性存在差异的原因,对今后流行病学的调查有一定的指导意义。  [方法]:  本实验以SPF巴马小型猪及野生型斑马鱼作为动物模型,检测了SS2菌株感染SPF巴马小型猪后致病情况,并计算了接种斑马鱼96h内LD50值,确定实验菌株,强毒株SH-08和无毒株SH-07YH,并以该两个菌株的基因组为模板,通过PCR的方法扩增与毒力相关的基因cps、mrp、epf、gdh、orf2、gapdh、sly初步判定各个菌株的毒力因子携带情况。  根据各菌株培养平板计数(CFU)结果,对SH-08及SH-07YH菌液,以每1h为间隔,按照倍比稀释法进行CFU计数及OD600测定,绘制两菌株生长曲线,比较细菌生长情况。在菌液OD600为0.4时(前对数期),收集菌株的表达上清。按照CFU值定量取SH-08及SH-07YH培养上清量(分别为50ml及76.5ml),并通过BCA技术进行蛋白定量。随后通过SDS-PAGE技术初步分析两菌株分泌蛋白表达图谱,评估后续定量蛋白组学实验的可行性。  首先通过胰酶分解上清蛋白,采用液质联用及串联质谱技术进行鉴定研究(ThermoQuest),随后经电喷雾方法,按照质荷比为400至2000范围进行全扫描,经SEQUEST软件分析,将肽段信息与SWISSPORT数据库中所有的链球菌种信息进行匹配。运用DeCyderMS软件将肽段质谱信息转化为类似双向电泳图形式,评价试验结果质量。基于定量比较蛋白组学的结果,在强毒株SH-08中特异性和高表达的蛋白用PCR和RT-PCR方法进行验证。  采用在线免费软件SignaIP2.0.B2(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-2.01)进行目的蛋白信号肽预测分析,含有信号肽蛋白通过PSORTI(http://psort.nibb.ac.jp/)软件进一步分析目的蛋白的细胞定位。  选择在强毒株SH-08及弱毒株SH-07YH中共表达,且在强毒株SH-08中表达上调的蛋白,将其定量蛋白数据及定量PCR数据进行统计线型回归分析(SPSS16.0),确定蛋白高表达与转录水平的相关性。  [结果]:  (1)动物致病力实验,SPF巴马小型猪在感染强毒株SH-08后均出现急性败血症并死亡,而无毒株SH-07YH感染后只有轻微的发热现象。斑马鱼(LD50)结果表明菌株SH-08的毒力远高于SH-07YH,明确了两株细菌的致病力,为接下来的研究奠定了基础。  (2)PCR方法扩增与毒力相关基因,表明SH-08与背景已知的强毒株ZY05719所含的主要毒力基因一致,相比而言,无毒株SH-07YH仅缺失了毒力基因fbps,而其他大部分毒力基因都存在,推测毒力因子缺失并非是造成致病力差异的关键原因。  (3)SDS-PAGE电泳鉴定SH-08与SH-07YH上清蛋白表达基本一致,但SH-08菌株存在更多的蛋白条带,部分蛋白条带表达量相比SH-07YH显著上调。结果证实后续定量蛋白组学实验具有可行性。  (4)本研究通过基于非标定量蛋白组学方法,结合DecydeMS软件进行猪链球菌2型强毒株SH-08及弱毒株SH-07YH分泌蛋白进行定量研究,结果证实了相比弱毒株SH-07YH,强毒株SH-08含有11个高表达分泌蛋白,29个特异性分泌蛋白。推测这些差异表达的蛋白可能与菌株毒力相关,为猪链球菌2型的毒力因子研究奠定了基础,为后续致病机制研究提供借鉴。  [结论]:  (1)应用野生型斑马鱼作为动物模型,比较了SS2菌株ZY05719、SH-07YH和SH-08之间的LD50。其中ZY05719株LD50值最低,其次为SH-08株,SH-07YH株LD50值则最高。表明菌株SH-08的毒力远高于SH-07YH。  (2)本研究通过基于非标定量蛋白组学方法,结合DecydeMS软件和生物信息学的方法,鉴定猪链球菌2型强毒株SH-08及无毒株SH-07YH分泌蛋白进行定量研究,结果证实了相比无毒株SH-07YH,强毒株SH-08含有11个高表达分泌蛋白,29个特异性分泌蛋白。
其他文献
对古代诗的思想内容和作者的观点态度的评价,在高考中出现在古诗词鉴赏中,而对这类题不少考生吃不准,似是而非,或不知所措。其实它一般包括三个方面:一是内容、主题的评价;二是思想感情的评价是;三是作者观点态度的评价。内容、主题方面包括意义的表层、深层评价,常识、典故、传说评价,经历、主张、志向评价;思想感情方面包括富有一贯性的意象评价、情感倾向评价。  评价思想内容,就是理解诗歌所表现的生活内容,把握其
大关县示范巨丰大豆获得成功大关县农牧局657400侯龙全大关县农推所农艺师刘顺屏,1993年引进巨丰大豆在翠华镇雄魁办事处农户张远奎家试种,获得每亩260千克的高产。1994年,在悦乐乡妥河村繁殖40亩,除
黑龙江省阿城市巨源乡新丰村村长冯长占,1993年开始引种被誉为宫廷进贡珍品的紫香黑玉米,经三年种植实践,掌握了它的生长习性,获得较高的经济效益。 该品种虽产量低,但品位
狂犬病街毒是一种嗜神经性,能引起几乎所有哺乳动物发生脑神经炎和100%致死性的病毒。其属于弹状病毒科,狂犬病病毒属,基因组为单股负链RNA病毒。基因组长约12kb,负责编码5种
晚播麦是指11月中旬以后播种的小麦。因为播种迟,难以苗全、苗匀、苗壮,不易获高产。湖北阳新县洋港镇“种粮状元”柯亨瑜对晚播小麦的高产施肥有一套办法: 1.施足基肥 晚播
猪圆环病毒2型(PCV2)是目前全球养猪业具有重要经济意义的重要病毒性病原体之一,现将与其感染相关的疾病统称为猪圆环病毒相关病(PCVAD),其中危害最严重的是仔猪断奶后多系统
苏联重型机械制造工业部和乌克兰苏维埃社会主义共和国黑色冶金工业部所属一些科研单位,最近联合研制出生产率为630m~3/h的ЭP-630-10.5/1新型轮斗挖掘机。该机的技术任务书
一、背景  诗歌欣赏课对于学生提高审美能力,体会母语的音韵美,有重要意义。但在中学教材中诗歌只是纯粹作为欣赏艺术让学生品味,并没有引起学生和教师的重视。因为在中招考试中,作为四大文体之一的诗歌,一直不提倡让学生写,在评价体系内也没有分值体现,这不利于现代诗歌真正在中学课堂登陆。但在高考中,检测学生的诗歌赏析能力又不可缺少。让中学生真正学会赏析诗歌,做好高中的过渡是不无裨益的。  二、教学目的  (
本文介绍了牟定铜矿充填矿房的矿柱回采,敞开矿房的矿柱回采,壁柱与矿房单步骤回采及阶段矿柱与矿房单步骤回采的生产实践。 This paper introduces the production practic
在国外现代采矿业中,目前广泛地采用各种不同形式的碎石机,进行采矿作业中(在采场、破碎机的入料口或格筛上部)的大块矿石二次破碎作业。在隧道和巷道掘进作业中,还用来挑顶