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北京鸭是我国著名的肉鸭品种,研究其采食性状的表型规律和遗传基础有助改良其饲料转化效率,提高生产性能,全面提升本土北京鸭品种的市场竞争力。本研究中,我们选择并使用自动采食记录系统记录了 358只雄性北京鸭的采食行为数据,并且比较了不同剩余采食量水平的肉鸭采食行为上的差异。结果表明,总采食时间、日采食量和每次平均采食量与饲料转化效率(RFI,FCR)性状之间存在很强的正相关关系;每次平均采食量和体重之间同样被发现存在显著的相关关系(R = 0.32,0.36;P<0.01);日平均采食速度和每餐时间与饲料效率之间有微弱的相关关系(R = 0.14～0.15,P<0.01);采食间隔与饲料利用率之间并没有发现显著相关。我们分析了每天采食行为的变化,发现高RFI水平的北京鸭在整个饲养期内都保持较高的饲料消耗,并在日采食次数与其他RFI水平肉鸭上有明显不同,并且随着年龄的增长,这些差异也逐渐扩大,但在每日有效采食次数不同RFI组别(高、中、低组)之间没有显著差异。本研究结果表明,自动采食记录系统能够准确记录北京鸭采食行为,同时部分采食行为对饲料转化效率有显著影响,有望用于新的育种指标。本研究开发了北京鸭简化基因组(Genotyping-By-Sequencing,GBS)分型平台。结果表明,从测试群体中鉴定出169,209个单核苷酸多态性位点(SNPs),平均每个个体鉴别出55,920个SNPs。在基因组上平均SNP密度达到1,156个SNP/MB。本研究是在北京鸭上首次应用GBS,结果证明了这种方法操作简便,分型效率高,可用于北京鸭遗传育种研究。本研究通过自动采食记录系统记录643只北京鸭的生长和采食表型,用GBS分型平台对其基因分型,然后进行全基因组关联分析,并计算了相应性状的遗传参数。结果显示,北京鸭体重相关的遗传力均为中高等程度,从0.44到0.86不等。3个阶段的体增重中,BW27-35和BW35-42的遗传力较低,平均为0.11,相较于前两者,BW21-27的遗传略高达到0.51。另外三个饲料转化效率性状的遗传力从0.20到0.37不等,属于低等遗传力,其中RFI最低,为0.21。通过对10个采食性状进行单点模型的全基因组关联分析,共得到34个QTL,其中包含42个显著性位点。在饲料转化效率上,我们发现了 11个显著的QTL。在性状FI和RFI上重叠的显著位点,这个位点位于1号染色体182Mb的位置,处于基因RNF17下游区段,在FI和RFI上分别能解释2.3%和3%的表型变异;在性状FCR关联的QTL中,显著性最高的是6号染色体25Mb位置的SNP,显著性达到1.65E-06,同时这个位点处于基因SORCS1第三和第四外显子中间,解释3%的表型变异。基因组关联分析结果显示,10个性状中BW42,BWG21-27,RFI存在较强的关联信号,共检测到9个显著基因,这些基因位于1号染色体三个不同的QTL区域。在139.0Mb到140.3Mb有3个基因(LOC101791418,TUBGCP3,ATP11A)与42天体重呈显著关联;在179.70-179.80Mb 区域内有 4 个基因(SHISA2,NUPL1,MTMR6,ATP8A2)与性状 BWG21-27显著关联,其中SHISA2基因显著性最高达到4.94E-07;在179.70-179.80Mb区域内有181.9-182.2Mb区域有两个基因(PARP4,CENPJ)与RFI显著关联。研究结果为北京鸭饲料转化效率性状的基因组选择提供新的参考,同时也有利于更好的研究饲料转化效率的遗传机理。