重庆市作为我国西部地区唯一的直辖市,同时也是重要的老工业基地。在经济增长速度由高速增长转换为中高速增长的新常态下,通过科技创新寻求重庆市新的经济发展动力,促进经济增长方式转型与经济结构优化十分重要与急迫。新世纪以来,重庆市高度重视科技创新在经济发展中的重要推动作用,工业行业研发创新投入与产出均逐年增加,但整体研发投入和产出仍处于全国中等水平。重庆市工业行业研发投入产出的效率如何?影响重庆市工业行业研发投入产出效率的主要因素有哪些?影响程度与影响方向如何?相关部门如何通过政策制定与制度创新提升重庆市工业行业研发投入产出效率,为重庆市经济高质量发展提供持久的动力,已成为各级政府与相关部门高度关注的重要课题。本研究在对国内外相关基础理论和研究现状进行梳理与评述的基础上,首先对2008-2016年重庆市24个工业细分行业的研发资本存量进行估算与分析;其次借助相关统计数据对2011-2016年重庆市工业细分行业研发投入和研发产出的现状进行描述性统计分析;再次采用因子分析法测算重庆市工业行业研发产出综合指数,采用随机前沿分析模型(SFA)对2011-2016年重庆市工业细分行业研发效率进行测算,对影响研发效率的因素进行实证分析;最后对提升重庆市工业行业研发投入产出效率的对策进行探讨。本研究得出如下基本结论:第一,重庆市研发资本存量及其变动趋势存在显著行业差异。整体而言,资本密集型与技术密集型工业行业研发资本存量较高,劳动密集型工业行业研发资本存量较低;除C35专用设备制造业和C25石油加工、煤炭和其他燃料加工业研发资本存量出现下降外,其他22个工业行业研发资本存量整体均呈逐年上升趋势;年均研发资本存量较高和研发资本存量中等的工业行业,研发资本存量增速相对较慢;年均研发资本存量较低的工业行业,研发资本存量增速相对较快。第二,重庆市工业行业研发人员投入及新产品销售收入、专利申请数量、有效发明专利数量及专利所有权转让和许可数等研发产出均存在显著行业差异。整体而言,研发人员投入与产出较高的工业行业主要为制造业中的资本密集型行业,这些工业行业一般是重庆市支柱性优势产业或“十二五”科学技术发展规划中重点发展的产业集群;研发人员投入与产出较低的工业行业主要为具有垄断性质行业或劳动力密集型行业。重庆市大部分工业行业研发资本投入和研发人力投入表现出一致性特征,研发资本投入处于较高水平的行业,研发人员投入也处于较高水平;部分工业行业研发资本投入和研发人员投入表现出不一致性特征,表现为研发人员投入较多、研发资本投入较少,或研发资本投入较多,研发人员投入较少。第三,重庆市工业行业整体研发效率仍处于较低水平,具有较大的提升空间,工业行业研发效率存在显著行业间差异。重庆市整体工业行业研发效率高于全国平均水平,但低于北京、上海等省际单位研发效率;重庆市研发效率高的工业行业或是重庆市传统优势行业,如C36交通运输设备制造业、C38电气机械和器材制造业等,或是重庆市“十二五”科学技术规划“2+10”重大项目和产业集群中重点扶持的行业;研发效率低于整体研发效率的工业行业大多为劳动力密集型行业或垄断经营性行业。第四,研发资本投入增加、研发人员投入增加、企业规模扩大、行业内企业数量增加带来的竞争程度提高、国有企业生产总值占行业生产总值比重提升、政府支持力度加大、行业出口贸易增强以及企业劳动生产率提高对重庆市工业行业研发效率提高具有促进作用;平均工资提高对重庆市工业行业研发效率提高具有抑制作用;工业行业研发效率与人均资本占有量之间呈现先下降后上升的U型变动关系。第五,提升重庆市工业行业研发效率的对策包括:从政府角度出发应构建完善的研发投入体系,促进研发资源优化配置;健全研发产出评价机制,完善法律法规保护知识产权;充分发挥大型国有企业的重要作用,积极培育中小企业发展;鼓励适当扩大行业开放度,引进国外先进理论和技术。从企业角度出发应树立创新理念,积极发挥主观能动性;提高创新投入的数量和质量,建立健全企业内部研发活动的监管体系。