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多粘类芽孢杆菌SC2是一株筛选于辣椒根际的促生菌,其抗菌谱广,对多种作物有明显的促生效果。为了进一步研究多粘类芽孢杆菌SC2与辣椒的互作机制,在温室条件下,分别用新茬土和重茬土种植辣椒,研究多粘类芽孢杆菌SC2对辣椒的促生效果,在无菌环境下培养辣椒苗,利用转录组分析探讨SC2和辣椒的相互作用机制。在新茬土盆栽试验中发现多粘类芽孢杆菌SC2能有效的促进辣椒的生长,施菌处理30d、40d时,SC2处理组较CK对照组的茎粗达到显著性差异(P<0.05),分别比对照组粗5.26%、5.7%。在处理50d时达到极显著性差异(P<0.01),比对照组粗6.52%。处理40d时叶长和叶宽都比对照组偏大,叶长较对照组达到显著性差异(P<0.05)。在处理20d、40d时处理组较对照组的叶绿素都达到显著性差异(P<0.05),叶绿素含量分别提高8.64%、14%。SC2处理组的土壤脲酶含量比C K组提高19.4%,达到极显著差异(P<0.01);蔗糖酶达到显著性差异(P<0.05),提高了18.3%。在重茬土试验中,SC2组比CK组辣椒的成活率高,抗病能力强。在处理10d、20d、30d时,SC2组和CK组相比较株高达到显著性差异(P<0.05),分别提高18.3%、9.8%、8.7%。SC2组辣椒的茎粗在整个生长期内都比CK组粗,且都达到显著性差异(P<0.05),在处理30d时达到极显著差异(P<0.01)。在重茬培养60d时对不同处理的辣椒根系活力进行了检测,SC2组辣椒根的总吸收面积、活跃吸收面积和总比表面积与CK组相比都达到极显著性差异(P<0.01),分别是C K组的1.9倍、2.3倍和1.22倍。重茬盆栽中SC2组的根系活力比CK组的根系活力强,有利于辣椒植株对营养的吸收。无菌环境下,辣椒和SC2相互作用20h时收集辣椒根和SC2菌体采用RNA-S eq技术,系统分析了多粘类芽孢杆菌SC2和辣椒互作转录组。发现辣椒有758个基因表达差异显著,其中573个基因上调、185个基因下调。辣椒KEGG通路中有15条通路显著富集,差异基因主要涉及代谢、防御和信号传导等。辣椒W RKY转录因子家族基因和病程相关蛋白相关的基因有显著的差异,热休克蛋白和谷胱甘肽转移酶等防御抗性基因的上调有利于辣椒的生长。SC2表达显著差异的基因有812个,其中465个基因上调、347个基因下调。SC2通路富集显著的途径有6条,差异基因主要涉及次级代谢、物质运输和分泌等。SC 2中与次级代谢产物fusari ci din、polym yx in合成相关的基因明显上调,生长素合成相关基因表达量显著提高,同时AB C转运系统中有42个基因明显的上下调。辣椒和SC2互作转录组的差异表达分析可以看出经过相互作用辣椒经过SC2的处理后防御代谢等相关的基因有很大变化,SC2经过与辣椒的作用代谢运输等相关基因表达差异,这为进一步研究辣椒和SC2互作机理奠定基础。