论文部分内容阅读
随着20世纪和21世纪人流感、禽流感及猪流感的暴发和流行，流感病毒已引起全世界的关注。犬作为伴侣动物携带流感病毒，在病原学、生态学及流行病学中占有举足轻重的作用，具有重要的公共卫生学意义。因此，对其基因组结构与功能的研究势在必行。本研究旨在对一株犬源流感病毒进行了RT-PCR扩增、克隆及序列分析。为研究流感病毒的基因功能、跨宿主传播机制、发病机制、免疫机制以及开发研制新型流感疫苗和预防药物奠定基础。
研究结果表明：犬源流感病毒CGZ1株的HA基因eDNA全长为1765Nt，编码566个氨基酸组成的HA蛋白；NA基因eDNA全长为1467Nt，编码469个氨基酸组成的NA蛋白；M基因eDNA全长为1027Nt，编码252个氨基酸组成的M1蛋白和97个氨基酸组成的M2蛋白；NS基因eDNA全长为890Nt，编码225个氨基酸组成的NSl蛋白和编码121个氨基酸组成的NS2蛋白；NP基因eDNA全长为1565Nt，编码498个氨基酸组成的NP蛋白；PA基因eDNA全长为2233Nt，编码716个氨基酸组成的PA蛋白；PBl基因eDNA全长为2341Nt，编码757个氨基酸组成的PB1蛋白；PB2基因eDNA全长为2341Nt，编码759个氨基酸组成的PB2蛋白。
通过序列比较：该株HA基因与A/chicken/Korea/S6/03(H3N2)的核苷酸序列(1701个核苷酸)的相似性最高，达96.5％，与A/canine/Florida/43/2004(H3N8)的核苷酸序列相似性较低，仅为72.7％；NA基因与A/duck/Korea/S7/03(H3N2)和A/duck/Korea/S8/03(H3N2)的核苷酸序列(1410个核苷酸)的相似性最高，达96.0％；与A/canine/Florida/242/2003(H3N8)的核苷酸序列的相似性仅为63.5％；M基因与A/mallard/Netherlands/12/2000(H7N3)的核苷酸相似性最高，为98.2％，与A/duck/Korea/S7/03(H3N2)的核苷酸相似性最低，仅为78.4％；NS基因与A/chicken/Nanchang/7-010/2000(H3N6)的核苷酸相似性最高，为95.8％；与A/chicken/Korea/S6/03(H3N2)、A/dove/Korea/S11/03(H3N2)、A/duck/Korea/S9/03(H3N2)、A/duck/Korea/S7/03(H3N2)、A/duck/Korea/S10/03(H3N2)、A/chicken/Henan/210/2004(H5N1)、A/quail/Dubai/303/2000(H9N2)、A/duck/Korea/S8/03(H3N2)、A/chicken/Netherlands/1/03(H7N7)、A/duck/Nanchang/4-184/2000(H2N9)、A/mallard/Denmark/64650/03(H5N7)和A/duck/Taiwan/WB459/04(H6N5)的核苷酸相似性较高，均在94％以上，与A/canine/Florida/43/2004(H3N8)的核苷酸相似性仅为89.7％；NP基因与A/chicken/Nanchang/7-010/2000(H3N6)的核苷酸相似性最高，达95.2％，与A/ducMKorea/S10/03(H3N2)的核苷酸相似性为35.9％，与近年来我国分离的禽源和猪源流感病毒毒株的核苷酸相似性也均在95％左右；PA基因与A/duck/Hokkaido/120/2001(H6N2)的核苷酸相似性最高，为98.1％，与A/dove/Korea/S11/03(H3N2)株的核苷酸相似性仅为49.4％；PB1基因与A/chicken/Nanchang/7-010/2000(H3N6)的核苷酸相似性最高为96.9％，与A/duck/Korea/S7/03(H3N2)的核苷酸序列相似性仅为48.3％，与2000年以来我国分离的禽源流感及猪源流感病毒的核苷酸序列的相似性较高，均在96％左右；PB2基因与A/duck/Guangxi/xa/2001(H5N1)的核苷酸相似性最高为97.2％，与A/chicken/Korea/S6/03(H3N2)的核苷酸序列相似性仅为44.2％，与2004年以来我国各地分离的禽流感及猪源H5N1亚型流感病毒的核苷酸序列的相似性也较高，其相似性均在97％左右。