夏代是中国传统历史上的第一个王朝，然而尚未发现证实夏代存在的文字考古证据，其真实性一直未获得国际普遍认可。二里头遗址地处中华文明起源的腹心地区，横跨夏商换代的历史时期，是探源中华文明和研究夏商分界的关键性遗址。考古界对二里头遗址的研究，以往多集中在对其出土的陶器、青铜器、兵器等物质文化资料以及墓葬方式、建筑结构等社会考古学方面，并通过相关遗址、相关文化的比较来推断夏代社会形态。但是对于该遗址人群的构成、来源及去向等问题，一直还存在着诸多疑问和争论，却无法通过传统考古学方法予以解决。本研究的目的就在于，利用分子考古学手段，对二里头遗址出土的夏代人群的遗传结构进行剖析，进而与数据库中其他世界范围内古今人群进行群体遗传学研究，以探讨二里头夏代人群的遗传构成、人群历史动态与去向等问题;同时对照史料记载中的夏代人流向，验证夏代存在的历史真实性。　　 本课题组前期从河南二里头夏代遗址采集了40例个体样本，严格遵循分子考古学操作标准，成功获得28例个体的线粒体DNA高变区Ⅰ序列，其中27例通过高变区Ⅰ和编码区划分了单倍群。本研究通过分析该人群的线粒体遗传结构，主要包括高变区Ⅰ序列的变异模式、单倍群类型与频率分布、共享单倍型在世界范围内的分布，结果均显示该遗址人群主要与亚洲人群接近，尤其是东亚东部和中国西北地区部分人群;另外发现该遗址人群具有多个母系谱系，遗传多样性丰富，通过对该遗址人群进行历史动态分析，结果表明二里头夏代人群经历过人口扩张和空间扩张，解释了该遗址人群多母系谱系、高遗传多样性的原因。　　 为进一步探讨二里头夏代人群的去向，我们采用群体遗传学方法比较了二里头夏代人群与世界范围内其他109个古今人群（其中42个中国群体）、共计7，732条个体序列，结果显示该遗址人群与东亚人群聚在一起，表明其为东亚起源，且后代也应分布在东亚人群之中。之后我们在东亚范围内又比较分析了二里头夏代人群与其他47个东亚古今人群、共计2，999条个体序列，通过主坐标分析、多维尺度分析及主成分分析，三种模型算法一致显示二里头夏代人群与黄河中下游地区（河南、山东、山西）汉族、西北（陕西、青海）汉族及少数民族、东北（辽宁、内蒙）汉族及少数民族，以及日本本州、韩国、外蒙古蒙古人群遗传关系非常近;与南方人群和阿依努人遗传关系较远;与偃师商城古人群和外蒙古匈奴时期古人群遗传关系介于上述二者之间。由此结合史料与文献记载，我们可以对夏代人的流向做出相应的科学推论，即夏代人群部分留在了当地、部分向西北迁徙、部分向东北迁徙、以及部分东渡过海，不支持部分史料所记载的阿依努人和浙江一带是夏代后裔的说法，与商代人及匈奴人的关系尚待验证。　　 上述几类与二里头夏代人群遗传关系密切地区的人群，包括中国北方人群、日本本州、韩国、外蒙古蒙古人群，共计22个群体、1,669条序列，我们又进一步对其重建群体NJ系统发育树，结果发现二里头夏代人群与内蒙东部蒙古族、山西汉族和山东青岛汉族位于一个支系上，提示夏代人对这些地区人群的基因库有更大的母系遗传贡献。　　 本研究首次利用分子考古学手段对夏代人群进行了研究，并且与大范围的世界各地古今人群共同进行群体遗传学研究，使用多种基于不同参数的分析方法相互验证，得到了一致的分析结果。不仅为解读夏代人的去向提供了分子生物学水平的证据，对夏代存在的真实性提供了自然科学的佐证，而且为复原中国古代人群遗传结构、迁移模式及研究中华民族和华夏文明形成积累了重要的科学数据。