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目的：通过检测软骨肉瘤和软骨瘤中WIF-1基因启动子区甲基化状态和Wnt-5a蛋白表达情况,探讨两者与软骨肉瘤的临床病理关系,为软骨肉瘤的分子靶向治疗和改善预后提供理论依据。方法：收集山东大学齐鲁医院病理科2005年至2011年石蜡包埋软骨肉瘤组织标本61例,采集患者病历资料及病理诊断信息,另选取石蜡包埋软骨瘤组织40例作为对照。应用甲基化特异性PCR法检测WIF-1基因在软骨肉瘤及软骨瘤中的甲基化情况,分析WIF-1基因甲基化与软骨肉瘤的临床病理关系。将石蜡组织标本制作成组织芯片,应用免疫组织化学SP法检测Wnt-5a蛋白在软骨肉瘤及软骨瘤中的表达情况,分析Wnt-5a蛋白表达与软骨肉瘤的病理分型、组织学分级、肿瘤侵袭性等的关系。采用SPSS19.0统计软件对所有数据进行统计学处理,各组间率的比较运用X2检验或Fisher精确概率法,采用双侧检验,以P<0.05为差异具有统计学意义。结果：1、软骨肉瘤与软骨瘤WIF-1基因甲基化阳性率分别为44.74%(17/38)、19.23%(5/26),差异具有统计学意义(X2=4.452,P=0.035)。WIF-1基因甲基化阳性率在不同的病理分型、组织学分级、侵袭性及年龄、性别等临床病理参数之间差异无统计学意义(P>0.05)。2、61例软骨肉瘤和40例软骨瘤Wnt-5a蛋白表达阳性率分别为57.38%(35/61)和12.5%(5/40),差异具有统计学意义(X2=20.341,P=0.000)。Wnt-5a蛋白在粘液型软骨肉瘤中的阳性表达率高于普通型,且差异具有统计学意义(P=0.016<0.05)。肿瘤组织发生浸润转移的软骨肉瘤组Wnt-5a蛋白表达阳性率高于未发生浸润转移的病例组(P=0.034<0.05)。1例透明细胞型软骨肉瘤Wnt-5a蛋白表达阴性。Wnt-5a蛋白表达与组织学分级、年龄、性别等其它临床病理因素均无关(P>0.05)。软骨肉瘤术后复发7例,Wnt-5a蛋白表达阳性者2例,2例均为粘液样软骨肉瘤,考虑Wnt=5a与肿瘤的复发无关。结论：1、WIF-1基因启动子区甲基化可能在软骨肉瘤发生的早期起作用,并可能异常激活了经典和非经典Wnt信号通路。2、软骨肉瘤Wnt-5a蛋白高表达与肿瘤的侵袭性成正相关。3、WIF-1基因甲基化与Wnt-5a蛋白过表达在软骨肉瘤形成中可能存在协同作用。