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目的:1.以C1GALT1、C1GALTl Cl、ST6GALNAC2作为候选基因,在新疆地区IgA肾病患者中筛查其单核苷酸多态的分布及频率。2.选择具有代表性的SNPs位点,探讨C1GALT1、C1GALTl Cl、ST6GALNAC2糖基化关键酶基因单核苷酸多态性与新疆地区IgA肾病临床病理的相关关系,从而为新疆地区IgA肾病早期发现干预、风险评估等提供新靶点。方法:选取维吾尔族及同期汉族IgA肾病患者,分别为90例和120例,选取同期健康体检者100例作对照,提取静脉血DNA进行PCR,对PCR产物直接测序,筛查C1GALT1、C1GALTl Cl、ST6GALNAC2基因的5’区、5’UTR、编码区、外显子相邻部分内含子、3’UTR、3’区,筛查C1GALT1、C1GALTl Cl、ST6GALNAC2的SNPs的分布,基因型和等位基因频率;等位基因及基因型频率采用直接计数法,基因型群体遗传学Hardy-Weinberg平衡估计采用HWE软件。通过SPSS17.0完成其他数据统计分析,两组间计量资料比较采用t检验,构成比采用2×2列联表χ2检验,P＜0.05差异有统计学意义。结果:1、候选基因单核苷酸多态的分布及频率筛查下载候选基因DNA和m RNA序列,进行序列比对,对DNA序列进行编辑和注释。针对候选基因编码区和调控序列,采用generunner8.0合成9对引物,以新疆地区IgA患者90个DNA作对照,对编码、调控区进行扩增及测序,应用软件读取测序峰图及序列图多态性。PCR扩增成功率达100%,次测序成功率则为65%,再经补测序后可达100%,测序总长度为9253bp。共发掘6个SNP,5个等位频率＞10%。在基因内不同区段,SNP分布密度有所差异。筛查基因组区段中,平均分布密度925.3bp/SNP。2.1入选研究对象的-般状况维吾尔IgAN组男41例,女49例,平均年龄38.81±11.06岁,汉IgAN组男66例,女54例,平均年龄39.14±10.22岁,对照组男50例,女50例,均为维吾尔族,平均年龄37.53±11.68,三组性别和年龄相匹配,差异无统计学意义（P＞0.05）。2.2 C1GALT1位点测序及基因频率分布2.2.1 Rs9639031位点测序结果rs9639031位点具有C/T二肽性,纯化测序结果显示,rs9639031有三种基因分型:CC型、TT型和CT型。IgAN组、汉IgAN组及对照组三种基因分型分布均符合H-W平衡定律。维吾尔IgAN组及汉IgAN组CC频率高,CT和TT频率较低。对照组则相反。三组间基因型频率无统计学差异（P＞0.05）;见表2。维吾尔IgAN组及汉IgAN组C频率高,T较低,对照组相反。三组间等位基因频率无统计学差异（P＞0.05）。见表2。分层分析:维吾尔IgAN组及汉IgAN组C等位基因频率均稍高于对照组,相比于T未发现C与维吾尔IgAN组及汉IgAN组的IgAN发病相关（P＞0.05）;维吾尔IgAN组及汉IgAN组的CC型频率比对照组高,与TT相比较没发现CC与维吾尔IgAN组及汉IgAN组的IgAN发病相关（P＞0.05）;维吾尔IgAN的CT型较对照组稍低,与TT相比,CT型与维吾尔IgAN组及汉IgAN组的发病也不相关（P＞0.05）。见表2。2.2.2 Rs5882115位点测序结果通过测序得出,此位点有3种基因分型:DD缺失纯合型、DI杂合子型、II插入纯合型。维吾尔IgAN组、汉IgAN组及对照组基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。维吾尔IgAN组和汉IgAN组DI和II基因型频率均较高,DD频率较低,对照组与之相反,维吾尔IgAN组和汉IgAN组与对照组基因型频率相比,均有统计学差异（P＜0.05）。维吾尔IgAN组和汉IgAN组基因型频率相比,无统计学差异（P＞0.05）。维吾尔IgAN组I频率18.3%,D 81.7%,汉IgAN组I频率16.1%,D 83.9%,对照组分别是8.3%和91.7%。维吾尔IgAN组和汉IgAN组与对照组等位基因频率比较,均有统计学差异（P＜0.05）。维吾尔IgAN组和汉IgAN组等位基因频率相比,无统计学差异（P＞0.05）。分层分析,维吾尔IgAN组及汉IgAN组的I等位基因频率稍高于对照组,与D相比,发现I可能与维吾尔IgAN组（OR=2.469,P=0.005）及汉IgAN组（OR=2.562,P=0.004）的IgAN发病相关。维吾尔IgAN组及汉IgAN组DI和II基因型频率比对照组高,分别与DD相比,发现DI可能与维吾尔IgAN（OR=2.874,P=0.004）和汉IgAN（OR=3.146,P＜0.001）的发病相关,表明维吾尔IgAN组及汉IgAN组DI基因型比DD患IgAN的危险性分别高2.874和3.146倍。维吾尔IgAN组及汉IgAN组II与DD比较,II与两组IgAN的发病无相关性（P＞0.05）。病理分级高的IgA肾病rs5882115基因DI基因型的频率明显高于DD、II,差异具有统计学意义（χ2=5.214,P=0.012）;病理分级高的IgA肾病I基因等位基因的频率明显高于D,差异具有统计学意义（χ2=6.024,P=0.008）。2.2.3 C1GALT1基因Rs1008898位点测序分型结果C1GALT1基因rs1008898位点A/G二态性,PCR扩增产物纯化测序后,该位点具有三种基因分型:AA型、AG型、GG型。维吾尔IgAN组、汉IgAN组及对照组各基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。维吾尔IgAN组及汉IgAN组AA、AG基因型频率较高,GG频率较低;对照组相反,IgAN组、汉IgAN组及对照组基因型频率无统计学差异（P＞0.05）。维吾尔IgAN组、汉IgAN组及对照组三组等位基因频率分布中,维吾尔IgAN组和汉IgAN组A基因频率分别为45.0%、,G频率分别为55.0%、;对照组分别是37.8%和62.2%。维吾尔IgAN组、汉IgAN组及对照组三组等位基因比较无统计学差异（P＞0.05）。分层分析,IgAN组和A等位基因频率高于对照组,与G相比,未发现A与维吾尔IgAN及IgAN汉的发病相关（P＞0.05）;IgAN组和汉IgAN组中AG基因型频率较对照组高,与GG比较,均未发现AG与维吾尔IgAN及汉IgAN的发病相关（P＞0.05）;维吾尔IgAN组和汉IgAN组中AA频率比对照组高,与GG比,AA与维吾尔IgAN组和汉IgAN组IgAN的发病均不存在相关性（P＞0.05）。2.3 ST6GALNAC2位点测序及基因频率分布2.3.1-988A＞G位点测序分型结果-988A＞G位点具有A/G二态性,通过对PCR扩增产物纯化测序,该位点具有三种基因分型:AA型、AG型、GG型。维吾尔IgAN组、汉IgAN组及对照组各基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。维吾尔IgAN组及汉IgAN组AA、AG基因型频率高,GG频率较低;对照组则相反;IgAN组、汉IgAN组及对照组三组基因型频率无统计学差异（P＞0.05）。维吾尔IgAN组及汉IgAN组A等位基因频率较高,G较低,对照组则相反,IgAN组、汉IgAN组及对照组间等位基因频率间无统计学差异（P＞0.05）。维吾尔IgAN组和汉IgAN组中AG基因型频率比对照组高,与GG基因型比较,均未发现AG基因型与维吾尔IgAN组和汉IgAN组IgAN的发病存在相关性（P＞0.05）;维吾尔IgAN和汉IgAN组中AA基因型频率比对照组高,与GG基因型相比,AA基因型与维吾尔IgAN组和汉IgAN组IgAN的发病可能都不存在相关性（P＞0.05）2.3.2 Rs1867561位点测序结果rs1867561位点具有C/G二态性,纯化测序PCR扩增产物后,有三种基因型:CC、CG、GG。维吾尔IgAN组、汉IgAN组及对照组基因型分布符合H-W平衡定律。维吾尔IgAN组和汉IgAN组CG、GG基因型频率较高,CC较低,对照组相反,维吾尔IgAN组和汉IgAN组基因型频率较对照组均有统计学差异（P＜0.05）。维吾尔IgAN组和汉IgAN组基因型频率相比,无统计学差异（P＞0.05）。维吾尔IgAN组和汉IgAN组G等位基因频率较高,C稍低,对照组则相反,维吾尔IgAN组和汉IgAN组等位基因频率较对照组均有统计学差异（P＜0.05）。维吾尔IgAN组和汉IgAN组等位基因频率相比,无统计学差异（P＞0.05）。分层分析,维吾尔IgAN组和汉IgAN组G基因频率均较对照组高（OR=2.034,P=0.001;OR=2.457,P=0.014）,提示G可能与维吾尔IgAN组和汉IgAN组IgAN的发病相关。维吾尔IgAN组和汉IgAN组携带G等位基因较携带C的人,发生IgAN的风险分别高2.034倍和2.457倍。维吾尔IgAN组和汉IgAN组CG、GG基因型频率比对照组高,分别与CC比较,维吾尔IgAN组和汉IgAN组CG与IgAN的发病相关（OR=2.273,P=0.012;OR=3.142,P=0.008）,即维吾尔IgAN组和汉IgAN组携带CG的较CC患IgAN危险性分别高2.273倍和3.142倍;维吾尔IgAN组和汉IgAN组GG与CC比较提示:GG与维吾尔IgAN组和汉IgAN组IgAN发病也相关（OR=3.979,P=0.012;OR=2.831,P=0.016）即维吾尔IgAN组和汉IgAN组携带GG的人较CC患IgAN的危险性分别高3.979倍和2.831倍。病理分级高的IgA肾病rs1867561基因CG基因型的频率明显高于DD、II,差异具有统计学意义（χ2=5.025,P=0.015）;病理分级高的IgA肾病G基因等位基因的频率明显高于C,差异具有统计学意义（χ2=6.125,P=0.007）。结论:（1）C1GALT1基因rs5882115位点多态性可能与新疆IgA肾病存在相关易感性,其中基因型DI和等位基因I可能为维吾尔族IgA肾病危险因素;（2）ST6GALNAC2基因rs1867561位点多态性可能与新疆IgA肾病存在相关易感性,其中基因型GG、CG及等位基因G可能为维吾尔族IgA肾病危险因素;（3）rs9639031、rs1008898和-988A＞G位点多态性与维吾尔族IgA肾病易感性无明显相关。（4）C1GALT1基因rs5882115与ST6GALNAC2基因rs1867561位点多态性可能与新疆地区IgA肾病的严重程度相关。（5）新疆地区维吾尔族和汉族IgA肾病的在各基因位点的基因型及等位基因频率均无显著差异,即无明显种族差异。