人类新基因AC3-33可变剪接体的鉴别和功能分析

来源 :华北理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woainami
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:RNA选择性剪接体不仅增加了mRNA表达多样性,在基因功能调节中也起着重要作用。在本研究中,我们基于表达序列标签的引物,利用MCF-7乳腺癌细胞系通过逆转录 PCR(RT-PCR)成功地克隆了一个新的AC3-33可变剪接体(NCBI参考序列:NM_001308229.1),我们对其命名为svAC3-33。通过研究svAC3-33的基本结构和功能,以及进一步探讨其作用机制。希望为乳腺癌的临床诊断和治疗提供理论基础,为基因治疗提供新思路。  方法:  1.svAC3-33生物信息学分析:通过DNAMAN、BioGPS等生物信息学软件分析预测基因的定位,信号肽相关信息;对svAC3-33的cDNA和相应的蛋白质序列比对;分析其在第三号染色体上外显子与内含子的位置信息。  2.重组载体的构建:把目的基因svAC3-33插入到表达绿色荧光蛋白的pEGFP-C3载体上,构建真核表达载体;构建沉默子质粒si-svAC3-33及其空白对照si-NC质粒。  3.细胞亚定位分析:倒置荧光显微镜检测GFP-sv-AC3-33融合蛋白的细胞亚定位。  4.细胞增殖检测:利用CCK-8技术检测细胞生长活力,绘制生长活力曲线;利用Edu实验检测细胞增殖情况,分析svAC3-33的过表达对 MCF-7细胞的增殖影响。  5.利用Transwell实验测定svAC3-33及si-svAC3-33对细胞迁移的影响。  6.荧光素酶活性检测各个转录因子的活性,筛选出svAC3-33能抑制转录因子AP-1的活性,并进一步利用荧光素酶活性检测转录因子AP-1的活性表达情况。  7.Western blot分析svAC3-33及si-svAC3-33对C-JUN和C-FOS表达的影响。  8.通过实时荧光定量qRT-PCR,检测在MCF-7细胞中过表达svAC3-33后P15,P21,P27,P53,cyclin-D1的表达水平。  9.实时荧光定量qRT-PCR检测在MCF-7细胞中沉默svAC3-33后,P21的转录水平表达情况。  结果:  1.该基因序列全长1825bp,由5个外显子和4个内含子组成,定位于3q25.31,CDS区域为共884bp编码294个氨基酸,比AC3-33多编码43个氨基酸。  2.本研究首先PCR证明了在MCF-7细胞中表达可变剪接体svAC3-33。  3.通过对svAC3-33和AC3-33外显子与内含子的位置信息比对发现svAC3-33缺少了Exon2。  4.成功的构建了重组质粒pEGFP-C3-svAC3-33,并验证了其在MCF-7细胞中表达;成功的构建了沉默子质粒si-svAC3-33及其空白对照si-NC质粒;Western blot结果表明si-svAC3-33构建成功并在MCF-7细胞中表达。  5.确定sv-AC3-33蛋白的细胞亚定位主要在细胞质。  6.通过CCK-8实验证实过表达svAC3-33对MCF-7细胞数目有显著地抑制作用,si-svAC-33沉默内源性svAC3-33表达后,细胞数目明显增加。  7.通过Edu实验证实过表达svAC3-33,处于S期的MCF-7细胞数目显著减少,细胞增殖速度显著减慢;与此相反,转染沉默子si-svAC3-33质粒组较空载si-NC质粒组,处于S期的MCF-7细胞数目显著增加。  8.通过Transwell实验验证了svAC3-33能明显的抑制MCF-7细胞迁移,而用RNA干扰技术沉默sv-AC3-33的表达后可以明显的促进MCF-7细胞迁移。  9.双荧光素酶活性实验检测结果表明,在MCF-7细胞中过表达svAC3-33能抑制转录因子AP-1的活性。而沉默svAC3-33后能促进AP-1的活性。  10.Western blot结果表明,在MCF-7细胞中过表达svAC3-33,C-JUN的蛋白表达水平显著地被抑制,而与之相比C-FOS则没有明显的差异。  11.实时荧光定量RT-PCR结果表明,在MCF-7细胞中过表达svAC3-33,P21的转录活性显著增加,如果降低sv-AC3-33的表达量,会使P21的表达下调。  结论:sv-AC3-33基因序列全长1825bp,由5个外显子和4个内含子组成,与AC3-33相比较缺少第二个外显子,定位于3q25.31,CDS区域为共884bp编码294个氨基酸。PCR证明了AC3-33可变剪接体svAC3-33的存在;确定sv-AC3-33蛋白的细胞亚定位主要在细胞质;证实svAC3-33对MCF-7细胞增殖的抑制作用,能明显的抑制细胞迁移;通过双荧光素酶活性实验检测各个转录因子的活性,发现svAC3-33能抑制转录因子AP-1的活性;进一步实验表明是C-JUN的蛋白表达水平显著地被转染svAC3-33组抑制,而与之相比C-FOS组则没有明显的差异;此外,我们发现svAC3-33可上调P21的表达。通过实时荧光定量qRT-PCR,发现降低sv-AC3-33的表达量,会使P21的表达下调。综上所述,我们的实验结果表明svAC3-33通过调节AP-1信号通路进而抑制MCF-7细胞的增殖,为乳腺癌的防治提供了一定理论基础。
其他文献
研究企业实施信息化对财务绩效的影响.现有研究中缺乏典型性的案例研究,为此,以青岛海尔、光明乳业两家企业实施信息化为例进行分析,得出总资产报酬率、净资产收益率受益并不
探讨平滑肌细胞对内皮细胞形态和功能的影响,为内皮细胞种植的组织工程学提供理论基础.该模拟血管壁的内层结构及内皮细胞平滑肌细胞间的相互影响途径建立内皮细胞与平滑肌细
加强基层党支部建设,既要靠基层党支部自我建设、自我提高,也要靠党委机关帮带指导。在帮带实践中,我们结合自身实际和特点,从理念、内容、机制入手,因地制宜,抓好具体落 To
为了准确地检测急性白血病(AL)多药耐药及寻求逆转AL MDR的药物,研究人员以48例AL患者骨髓细胞为研究对象,通过SABC方法检测P蛋白(Pgp),结果发现它只能检测具有Pgp过度表达的
目的:筛选3日龄家蝇幼虫血淋巴中的具有抗肿瘤作用的蛋白;通过体外实验初步探讨抗肿瘤蛋白对Hep-2细胞系的作用机制。  方法:1、家蝇幼虫血淋巴蛋白的制备:采用针刺法提取
新冠肺炎疫情期间,为响应教育部“停课不停学”的号召,保证教学活动的正常开展,线上教学必不可少.慕课平台是线上教学平台的典型代表,为师生间的互动创造了良好的条件.激发学
该研究以脾、胸腺和巨噬细胞为研究对象,围绕其细胞因子和SOD的表达及巨噬细胞吞噬功能和增殖功能等指标,进一步阐明LDR对免疫功能和抗氧化功能的影响以及CK之间相互作用的内
本文通过介绍播客的特点以及播客对教师教学和学生学习的作用,分析了播客与广播电视编导教学的密切联系以及播客在广播电视编导领域的广阔应用前景。 By introducing the ch
目的:研究用不同的免疫方法恶性疟原虫多表位重组疫苗免疫效果的影响.结论:不 同的银川市方法不仅影响多表位疫苗刺激机体产生IgG抗体总水平及IgG抗亚型,而且影响多表位疫苗
目的:建立一种简便、快速、敏感、特异的检测华支睾吸虫抗体的新方法。方法:以华支睾吸虫成虫抗原为包被抗原,金标记SPA为显色剂,建立检测华支睾吸虫抗体的斑点金免疫渗滤法(DIGFA