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本论文从表型性状、SSR分子标记及亲缘系数三个方面入手,分析了我国陆地棉基础种质和4个基础种质衍生系的遗传多样性及亲缘关系,主要结果如下: 1、基础种质间主要表型性状差异显著或极显著,遗传多样性指数为0.88,品种间差异明显,多样性可涵盖我国95%以上的育成品种,说明所选基础种质代表性强。 2、我国目前育种的三期基础种质,第二、三期比第一期的纤维长、整齐度高,细度好,衣分大,早熟性提高,抗病、耐旱性也增强。第一、二、三期基础种质SSR分子标记平均遗