缢蛏选育系生长参数估计和α-淀粉酶基因外显子区域SNPs筛选及生长关联分析

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:hmsx
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缢蛏(Sinonovacula constricta)广泛分布于我国沿海地区,是我国四大海产贝类之一,随着种质资源的退化以及海区环境的恶化,本实验室从2008年起一直以选择强度2.063、壳长为选择指标的条件下对浙江乐清群体进行选择育种,经过连续数代的选育工作获得缢蛏快长选育系群体。为了评估选择指标稳定遗传的能力,采用平衡巢氏设计方法,按照1雄配2雌的方式,构建缢蛏7个半同胞家系和14个全同胞家系,分别测定各个家系60日龄、90日龄及150日龄的壳长、壳高。雄内雌间半同胞个体间具有较大的变异程度,存在显著的母性效应,故以父系半同胞组内相关法计算的狭义遗传力为缢蛏快长选育系生长性状遗传力的无偏估计值。60日龄、90日龄和150日龄壳长的狭义遗传力分别为0.298、0.541、0.574;60日龄、90日龄和150日龄壳高的狭义遗传力分别为0.139、0.519、0.518。壳长和壳高在3个日龄的遗传力属于中等遗传力水平,显示出较高的选择育种潜力。缢蛏幼贝壳长、壳高两个指标间的遗传相关和表型相关均为正相关(P<0.05)。60日龄、90日龄和150日龄壳长-壳高性状间遗传相关系数分别为0.980、0.755、0.942,表型相关系数分别为0.910、0.882、0.912。表明缢蛏幼贝期以壳长或者壳高作为选育参数进行选择育种,可达到改良缢蛏快长选育系生长性状的效果。α-淀粉酶(Alpha amylase)是广泛存在于生物体内的消化酶,主要参与生物体内碳水化合物的代谢,为生物体提供维持生命、生长发育和繁殖所需的能量。为研究α-淀粉酶基因外显子与缢蛏(Sinonovacula constricta)生长性状的相关性,实验采用PCR产物直接测序比对获得18个候选SNPs位点,分别为:Rs-1:48 G/C、Rs-2:247 C/A、Rs-3:420 A/G、Rs-4:441C/T、Rs-5:537 G/T、Rs-6:837 G/T、Rs-7:936 A/G、Rs-8:952A/C、Rs-9:1047 T/G、Rs-10:1062 C/T、Rs-11:1287C/T、Rs-12:1350 A/C、Rs-13:1362 C/T、Rs-14:1371 C/T、Rs-15:1503T/C、Rs-16:1536 T/C、Rs-17:1737T/C、Rs-18:1788 C/T。随机选取同批繁殖、同塘养殖的缢蛏选育系群体,运用MassARRAY质谱检测方法进行SNPs位点的分型。结果显示:除Rs-13位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),Hardy-Weinberg平均值为0.581;多态信息含量平均值为0.237。基因型与生长性状的关联性分析结果表明:Rs-5:537 G/T与Rs-10:1062 C/T位点各个基因型个体之间部分性状存在显著性差异(P<0.05)。13个位点组成的双倍型与生长性状的关联性分析显示:S6(壳高)高于S3、S5、S7(P<0.05),S6(总重)大于S7(P<0.05);另外,S6各个生长性状值在所有双倍型中最高。所获得的缢蛏α-淀粉酶编码区外显子与生长性状相关的SNPs标记,能为缢蛏遗传改良特征标记筛选及定制培育提供有益参考。
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