创建以piggyBac和episome为基础的CRISPR/Cas9递送系统

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tysystem
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
以CRISPR/Cas9为代表的第三代基因组编辑技术已经被广泛用于基础研究、品种改良和生物医疗等领域。CRISPR/Cas9技术包含两个不可或缺的元件-Cas9核酸酶和单链导向RNA(Single Guide RNA,sgRNA),两种元件发挥作用的形式包括体外转录的Cas9 mRNA和sgRNA复合体、Cas9蛋白和sgRNA复合体及包含编码Cas9蛋白和sgRNA的载体。前两种递送形式的安全性高,但是因为体外转录或蛋白纯化过程较为复杂,不利于普遍推广使用。普通载体虽然方便科研工作者使用,但是其基因编辑效率不稳定且具有整合入细胞基因组后不方便被检测到的风险。因此,亟待开发一套高效稳定且可实现无载体残留的新型CRISPR/Cas9打靶系统。针对以上问题,本研究分别采用piggyBac转座子系统和episome游离体系统两种载体形式,希望可以打破普通载体对于基因编辑技术的束缚,更好地推广CRISPR/Cas9技术的应用。本研究构建了基于piggyBac且响应DOX调控的人源化Cas9(hCas9)表达载体系统(PB-iCas9系统)。首先,本研究选取体外培养的小鼠胚胎干细胞(Mouse Embryonic Stem Cells,mESCs)检测并最终证实了 PB-iCas9系统对Cdkn2a、Pten和Trp53三个肿瘤抑制基因(Tumor Suppressor Genes,TSGs)的单基因编辑能力。然后,本研究选取3-4周龄CD1小鼠,通过尾静脉注射PB-NRAG12V IRESEGFP过表达载体和同时敲除Cdkn2a、Pten和Trp53的PB-iCas9混合载体,并在饮水中添加DOX诱导hCas9表达,最终证实PB-iCas9系统能在活体小鼠肝脏中同时敲除多个TSGs,诱导肝脏肿瘤的发生,为构建活体肝脏肿瘤模型提供了工具,这些结果证实了 PB-iCas9系统具有良好的基因编辑能力。最后本研究通过反向PCR寻找PB-iCas9整合入小鼠基因组的位置,并通过qPCR法确定其严格响应DOX调控,瞬时表达PB酶后实现PB转座子的无缝去除,并证实经PB-iCas9系统整合/切除的mESCs核型正常、多能性基因Nanog和Oct4表达正常,表明PB-iCas9系统可用于分离无外源打靶载体残留的mESCs。本研究还构建了基于oriP/EBNA1元件的episome载体系统(oe-Cas9系统)。首先,本研究将重编程因子及表达红色荧光蛋白tdTomato的载体元件递送入小鼠成纤维细胞,并鉴定出整合单拷贝tdTomato的小鼠诱导性多能干细胞(Mouse Induced Pluripotent Stem Cells,miPSCs),以 oe-Cas9系统转染针对tdTomato的sgRNA之后,检验并证实oe-Cas9系统可以实现对外源整合荧光报告基因的单基因修饰。然后,本研究用HeLa细胞证实了 oe-Cas9系统具备双sgRNA介导的基因组片段删除和位于不同染色体上的三基因同时修饰的能力。在确定了 oe-Cas9系统的基因编辑能力之后,本研究还检测了单克隆细胞系的外源载体去除情况,结果表明无论是DNA水平还是蛋白表达水平,利用oe-Cas9系统均可以成功获得无外源打靶载体残留的基因修饰细胞系。以上实验结果表明,PB-iCas9系统和oe-Cas9系统均可以实现对靶细胞的高效基因组编辑,并最终获得无外源打靶载体残留的细胞系。鉴于载体递送系统的简便性,PB-iCas9系统和oe-Cas9系统将扩展现有的CRISPR/Cas9递送系统,为肿瘤模型的构建、转基因细胞或模式动物的制备提供新的思路。
其他文献
软凝胶类颗粒乳化剂具有优异的乳化效率和乳化稳定性,具有广阔的应用前景,但是软凝胶颗粒乳化剂的乳化稳定机制尚不明确,且目前无食品级凝胶颗粒乳化剂产品。本研究以酪蛋白为原料,实现了不同直径、硬度和ζ-电势的酪蛋白凝胶颗粒的可控制备,并从界面吸附能力、界面排布和界面膜强度等方面阐明了酪蛋白凝胶颗粒的乳化稳定机制。主要研究结果如下:(1)通过调节酪蛋白分子间氨基的交联度,实现了酪蛋白凝胶颗粒硬度的调控,评
植物的自交不亲和性反应是一种花柱与花粉间的特异性识别反应,贯穿于整个花柱对花粉的拒斥过程中。正常生长的花粉管微丝细胞骨架处于动态的装配状态,其装配包括微丝骨架的切割、解聚、聚合、加帽、成束等作用,这些不同的装配方式处于一种协调的状态。其中,微丝的切割作用可为花粉管提供大量的游离的且有活性的微丝小片段,这为微丝的聚合、加帽、成束等作用提供基础。在花粉管生长过程中,多种胞外刺激都会导致细胞骨架的迅速的
目前,肥胖、胰岛素抵抗以及相关代谢性疾病已经成为一个严峻的公共健康问题,严重威胁人类健康。课题组前期已经证明,酪蛋白糖巨肽木瓜蛋白酶水解物(Casein glycomacropeptide hydrolysates obtained by papain,GHP)具有较酪蛋白糖巨肽本身更强的抗氧化与抗炎活性,然而,关于GHP对肝脏胰岛素抵抗的改善作用尚不清楚。本研究以HepG2肝细胞和C57BL/6
哺乳动物脂肪细胞可以分成白色脂肪细胞、褐色脂肪细胞和米色脂肪细胞。其中白色脂肪主要以甘油三酯的形式储存过剩能量,褐色脂肪和米色脂肪可以通过非颤抖性产热作用将能量转化成热量。有研究表明,下丘脑促进交感神经释放去甲肾上腺素,去甲肾上腺素通过β3-AR受体激活褐色脂肪和米色脂肪细胞产生热量。褐色脂肪细胞通过位于线粒体内膜的解偶联蛋白1(Uncoupling Protein 1,UCP1)产生热量的机制已
虽然铵态氮和硝态氮是植物生长直接吸收利用的主要氮素形态,但是土壤中90%以上的氮素以有机态存在,其中氨基酸是土壤中主要的小分子有机含氮化合物,占土壤全氮的15-60%。氨基酸作为氮素营养能被植物根系吸收,也可能作为信号分子调控植物的生长发育。Walch-Liu等曾发现,50μM的L-谷氨酸(L-Glu,简写Glu)即可强烈抑制拟南芥C24幼苗的主根生长并激发较多的侧根发育,故而推测Glu可能像在动
肌球蛋白是肌肉组织的重要组成蛋白质,肌球蛋白凝胶的特性决定了肉制品持水性、硬度及黏弹性。肌球蛋白在温度等外界条件影响下,蛋白聚集状态、结构等发生改变,进而影响到最终凝胶特性,但是热诱导凝胶形成机制尚不明确。本论文以猪通脊肉为实验原料,建立了猪肉肌球蛋白有效解离的方法,研究了肌球蛋白在不同Na+、Ca2+及pH值条件下的热聚集行为,探究了肌球蛋白在不同Na+、Ca2+及pH值条件下热诱导凝胶的形成机
生物被膜是多数细菌自然状态下的一种生长方式,有助于菌体抵抗外界环境胁迫,其形成与发展常受到群体感应(Quorum sensing,QS)系统的调控。然而,目前研究多集中于病原菌,涉及益生菌的相关研究非常匮乏。类植物乳杆菌L-ZS9分离自发酵肉制品,产Ⅱb类细菌素,对结直肠癌细胞有抑制作用,具有开发为益生菌及发酵剂的潜力。本研究以L-ZS9菌株为材料,在分析其生物被膜生理优势、影响因素及具有LuxS
Small RNAs 中的 microRNAs(miRNAs)和 trans-acting siRNAs(tasiRNAs)在植物生长发育、胁迫响应等多种生理生化过程中发挥重要作用。近年来,高通量测序产生了大量的small RNAs序列,而采用转基因方法表达人工miRNAs(artificial miRNAs,amiRNAs)来研究miRNAs的功能费时费力。本研究对中国番茄黄化曲叶病毒(Toma
小麦白粉病(Blumeriagraminisf.sp.tritici)是小麦主要病害之一,严重威胁小麦的生产安全。实践证明,最经济有效的方法就是培育抗病品种,而培育抗病品种的关键是寻找新的抗白粉病基因。小麦穗部蜡质作为小麦与外界接触的最外层物质,能保护小麦免受紫外线和害虫的伤害,有研究证明蜡质与小麦的抗旱性有重要关系,对小麦的生长发育具有重要的意义。野生二粒小麦含有丰富的抗病资源和较多的变异类型,
有机农业作为一种环境友好型生产模式,改善了土壤的养分平衡状态,其中土壤微生物是养分元素循环的主要参与者,在土壤肥力的形成和维持中起重要作用。本试验以2002年建立于中国农业大学曲周实验站的日光温室有机、无公害与常规蔬菜长期定位试验为研究对象,连续2年系统地研究不同种植模式下的氮素动态和平衡,同时利用实时荧光定量PCR分析介导氮素形态转化的固氮细菌、氨氧化细菌(AOB)、氨氧化古菌(AOA)和反硝化