2019年12月,一场突如其来的新冠肺炎事件在全国爆发,给全国各行各业带来了非常严重的影响。为了更好的防控新冠状肺炎的影响,国家采取了有效的防控策略,所有企业停工,所有商店关门,所有学校停课。为了实现我国经济的复苏,国家正在着手各行各业的复工复产,高职院校也会在政府部门的调控下分批次开学。为了更好的实现开学后的疫情管理,本文就高职院校新冠肺炎疫情的应急方案进行分析,得出其疫情应急预案中存在的问题以及可以采取的应对策略,确保高职院校开学后各项工作的正常开展。论文分析了高职院校、高职院校学生以及高职院校突发事件的特点,如高职院校应急物资储备不足、师资薄弱,应急管理专业人才欠缺、青年教师偏多,应急管理经验不足;高职院校学生的自信心较差、心理素质水平较低、自律意识较差和自我意识较强;高职院校突发事件呈现出较高的随机性、复杂性、危险性和可控性,为新冠肺炎疫情应急管理预案的制定和分析奠定了基础。论文重点就高职院校新冠肺炎疫情的应急管理情况进行分析,采用调查问卷的形式对高职院校健康教育、卫生预防、公共场所卫生以及医疗机构和人员情况进行了调查。通过对调查问卷中数据的分析发现高职院校突发公共卫生事件应急管理中存在学生防范意识薄弱、防范措施实施不到位、应急预案实施效果差、管理人员职能不明确以及保障机制不健全等问题。造成高职院校突发公共卫生事件应急管理问题的原因有三个方面,分别是社会应急管理资金投入力度不足、高职院校对应急事件管理的重视程度不够以及大学生公共危机意识淡薄。为了更好的实现对疫情的管理,论文给出了三个方面的解决的对策,即提高认识、完善预案和加强演练。为了确保新冠肺炎应急管理的顺利实施,高职院校还要进一步加强专业化心理辅导队伍的建设力度、构建高职院校新冠肺炎疫情心理问题的预警机制以及层次多样的监督系统。