3、7型腺病毒纤毛与六邻体基因序列分析

来源 :重庆医科大学 重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fz1122
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1背景:2009年6月至2011年2月课题组从呼吸道感染住院患儿中共检出人腺病毒(Human adenovirus, HAdV)阳性标本105份,其中3型55例,7型40例,5型4例,1型4例,55型1例,2型1例,而2010-2011年冬,腺病毒感染率激增。由于HAdV易发生血清型间重组现象。为进一步明确是否因重组造成了HAdV的感染率激增,本研究分析比较前期临床分离的3,7型HAdV纤毛(Fiber)与六邻体(Hexon)蛋白的基因序列。方法:从2009年6月~2011年5月,收集因呼吸道感染在重庆医科大学附属儿童医院呼吸病房住院患儿鼻咽抽吸物(Nasopharyngeal aspirates, NAPs)1780例。所有标本进行HAdV PCR扩增,腺病毒阳性者测序,基因库进行比对确定血清型。对所有HAdV-B阳性分别进行Hexon高变区(Highly variable region, HVR)及纤毛蛋白基因PCR扩增测序,并对3型和7型腺病毒进行进化树分析(Phylogeny analysis)及相似度分析(Similarity analysis)。根据已确定的腺病毒血清型进行相关临床资料分析,统计分析软件使用SPSS17.0。结果:重庆地区引起儿童急性呼吸道感染(Acute respiratory tract infection, ARTI)的腺病毒血清型主要为3型和7型。Logestic回归分析发现,HAdV-7相对于HAdV-3更容易致重症肺炎(OR=0.089,95%CI0.021-0.375)。建立所有B组HAdV进化树,并未发现重组现象。SimPlot相似度分析发现HAdV-3和HAdV-7序列差异集中在纤毛蛋白(Fiber)的基因序列。结论:HAdV-3和HAdV-7是引起重庆地区儿童ARTI的主要血清型,但两者引起肺炎严重度不同。基因序列分析提示纤毛蛋白序列差异可能导致HAdV-3和HAdV-7腺病毒相关肺炎严重度差异。
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