1994年，关贸总协定乌拉圭回合中达成的《与贸易有关的知识产权协议》（简称“TRIPs协议”），是当今世界知识产权保护领域中涉及面较广、保护水平较高、保护力度较大、制约力较强的一个国际公约，受到各成员国的高度重视。根据TRIPs协议的规定，对专利权的保护除了可以采用司法保护外，还可以采用行政保护的手段。当发生专利权侵权纠纷时，权利人既可以选择向法院起诉，也可以选择向相关的行政管理机关提出申诉，这即是“双轨制”的保护模式。它不仅是TRIPs协议的规定，符合知识产权自身特点和要求，而且有利于我国专利权制度平稳、健康的发展。　　近年来，我国在专利权保护方面开展了扎实有效的工作，取得了举世公认的成绩和进步。然而，由于种种原因，专利权“双轨制”保护模式在实践中存在着种种不足，其中，专利权的行政保护模式更是饱受非议。因此，对专利权“双轨制”保护模式进行一次系统的、全方位的阐述，分析存在的问题，就如何完善专利权的“双轨制”模式进行探讨，抓住两种保护模式之间的契合点是十分有必要的。　　本文结合现行《专利法》与2015年12月发布的《专利法修订草案（送审稿）》，对专利权的行政保护、司法保护进行了较为有新意的论述，并试图预测中国未来专利权保护的走势。通过深入分析TRIPs协议对我国专利权保护带来的影响，比较发达国家专利保护体系的特点，阐述了我国专利权保护存在的问题，并指出为了“双轨制”保护模式的协调发展，应该从完善专利权行政执法机制、探索专利权司法审判新机制、完善专利权行政保护与司法保护的协调机制三个方面出发，从而能够既公正又高效地实现专利权保护，维护权利人的权益，营造更好的利于专利权发展的环境。