2010年5月至2011年4月，对洱海叶绿素a、浮游植物和浮游甲壳动物的季节动态、空间分布及其与环境因子的关系进行了研究。结果表明，水体中叶绿素a浓度在夏、秋季较高，冬、春季较低，其变化范围为4.11-24.3μg/L，年平均值为10.4±6.5μg/L，最小值（4.11μg/L）出现在3月，最大值（24.3μg/L）出现在9月。在空间变化上，叶绿素a浓度在南部湖区最大，其次是北部湖区，中部湖区最低。Pearson相关系数和PCA分析暗示，洱海叶绿素a浓度在不同湖区中与水温和透明度均呈极显著相关（p<0.001）。总氮在北部（p=0.096）和南部湖区（p=0.024）与叶绿素a浓度均存在一定的联系，而总磷与叶绿素a浓度在南部湖区（p=0.076）存在一定的联系。根据修正的卡尔森营养状态指数，洱海综合TSI值为50.6，水质处于中营养状态。　　共记录洱海浮游植物8门72属124种，其中绿藻43属75种、蓝藻9属17种、硅藻13属23种。洱海浮游植物生物量的变动范围是0.68-3.25 mg/L，其年平均生物量为2.31mg/L，其中硅藻、绿藻和蓝藻的年平均生物量分别为1.21 mg/L、0.6 mg/L和0.31 mg/L，分别约占总生物量的52％、26%和13.3%。最大生物量（3.25 mg/L）出现在5月，最小生物量（0.68 mg/L）出现在4月。冬、春季节以钝脆杆藻（Fragilaria capucina）、颗粒直链藻（Melosira granulata）为优势种；夏季以梅尼小环藻（Cyclotella meneghiniana）和铜绿微囊藻（Microcystis aeruginosa）、惠氏微囊藻（M.wesenbergii）、绿色微囊藻（M.viridis）.为优势种；秋季以暗丝藻（Psephonema aenigmaticum）和颗粒直链藻（M.granulata）、梅尼小环藻（C.meneghiniana）及绿色微囊藻（M.viridis）为优势种群。Pearson相关系数及统计结果可知，浮游植物生物量与叶绿素a（r=0.443，n=144，p<0.001）、总氮（r=0.279，n=144，p<0.01）、水温（r=0.520，n=144，p<0.001）、枝角类密度（r=0.373，n=144，p<0.001）和桡足类密度（r=0.465，n=144，p<0.001）呈极显著正相关，与透明度（r=-0.707，n=144，p<0.001）呈极显著负相关，而与其它环境因子无相关性。除营养盐、水温外，鱼类可能是影响洱海浮游植物群落结构和生物量季节变化的重要原因。　　洱海共记录浮游甲壳动物13种，其中枝角类8种，隶属于4科6属，桡足类5种，隶属于2科5属。Daphnia为冬、春季主要优势种，在夏季和秋初消失；简弧象鼻溞（Bosmina fatalis）、圆形盘肠溞（Chydorus sphaericus）和广布中剑水蚤（Mesocyclops leuckarti）为夏、秋季主要优势种。浮游甲壳动物的年平均密度和生物量分别为66.8 ind./L和0.85 mg/L，夏、秋季较高，冬、春季较低，枝角类的年平均密度和生物量均高于桡足类的年平均密度和生物量。枝角类的密度和生物量的最大值（125ind./L和1.03 mg/L）出现在2010年7月，Daphnia（27.9 ind./L）出现在2011年3月，剑水蚤的最大密度（34.1ind./L）出现在2010年8月。北部湖区浮游甲壳动物的密度和生物量最大，其次是中部湖区，南部湖区最低。太湖新银鱼和浮游植物是影响洱海浮游甲壳动物密度和群落结构季节变化的重要因素。