碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌耐药机制及同源性研究

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肺炎克雷伯菌是院内获得性感染中最为常见的致病菌之一,主要引起肺炎、败血症、尿路感染、肝脓肿及腹膜炎等。随着抗菌药物的广泛使用,尤其是碳青霉烯类抗生素的大量或不合理使用,碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(Carbapenem-resistant Klebsiella pneumonia, CRKP)呈现全球播散趋势,在我国分离率逐年攀升,对临床治疗带来极大挑战。本研究旨在探讨本院CRKP院内感染相关危险因素和耐药机制,并分析其同源性和院内感染流行现状,为CR KP的防控提供科学的理论依据。本研究收集了来自本院8个临床科室的30株CRKP,制定统一调查表收集临床资料并进行分析。采用纸片扩散法进行常见药物的体外敏感性实验,并用改良Hodge试验检测所有菌株是否产碳青霉烯酶。所有菌株均利用脉冲场凝胶电泳(Pulsed field gel electrophoresis, PFGE)和多位点序列分型(Multilocus sequencetyping,MLST)两种技术进行同源性分析,部分菌株进行全基因组测序(Whole genome sequencing, WGS)分析亲缘关系远近。临床资料显示30位感染患者的平均年龄较高(72±15岁),各项病情评分指标均显示病情严重。基础疾病中神经系统疾病、糖尿病和心力衰竭患者占了前三位。而有90%的患者在三个月内使用过p-内酰胺酶抑制剂合剂,50%多的患者使用过碳青霉烯类。近三个月内绝大多数患者曾留置导管,例如导尿管、深静脉导管和气管导管等。体外药物敏感性实验显示所有菌株对美罗培南和厄他培南耐药,除一株对亚胺培南为中介外其余也全部耐药。对三、四代头孢、复合制剂所有菌株均耐药。而对环丙沙星、庆大霉素和阿米卡星的耐药率分别是90.0%、97.0%和87.0%。所有菌株对多粘菌素E和替加环素均无耐药。耐药酶基因检测结果提示30株肺炎克雷伯菌在携带blaKPC-2的同时均带有blasHV。此外,有部分菌株还同时带有blacTX-M和blaTEM。PFGE将所有菌株分为A-H8个克隆群,主要有2个克隆群出现院内播散,分别是A和C克隆群。MLST分析得到5种序列型(Sequence type, ST),其中23株属于ST11,3株属于ST437,2株属于ST290,另外两株分别为ST133和ST15。5株A克隆(ST11)菌株的全基因组测序将5株细菌分为3个不同的群组(2株:2株:1株),同一群组的菌株为一簇,亲缘关系密切,单独的那株自成一簇,与前两簇关系疏远。因此,WGS较PFGE和MLST更深入的揭示了菌株的遗传背景,更利于菌株的溯源追踪。综上所述,CRKP感染患者具有多种危险因素,患者预后情况与多种危险因素和治疗相关。初始经验性抗感染治疗应根据感染危险因素进行选择,并及时综合分析患者病情,结合药敏结果进行目标治疗。产肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(Klebsiella pneumoniae carbapenemase, KPC)2型是本院CRKP耐药的重要原因,多种耐药基因的共同携带导致其多重耐药表型。ST11型克隆播散是本院感染流行的重要原因,应加强医院感染监控力度。
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