抗重组腺相关病毒DNA适配体的制备及试用于纯化rAAV

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重组腺相关病毒(rAAV)作为疫苗和基因治疗载体而备受业界重视,但其批量生产存在诸多痛点,特别是纯化难度高、受限于血清型依赖性、梯度离心法无法大规模制备,混合色谱成本高,分子排阻纯化步骤繁琐。rAAV纯化工艺的进步有赖于新型亲和材料的出现。本研究基于肝素能和2型AAV衣壳硫酸肝素受体相结合的特点,改良指数富集的配体系统进化技术(SELEX)技术,采用全新的Heparin beads固定rAAV,第6-10轮采用灭活病毒反筛,第11轮文库进行点杂交,Eastern blotting出现阳性结果后,导入T5-Zero质粒进行筛选阳性重组子。筛选出了一组与rAAV-EGFP特异性结合的DNA适配体序列,rAAV-EGFP适配体序列未曾见过报道。筛选出的适配体经过点杂交、Eastern blotting和QCM-D表征,显示特异性;纳米金变色在0.4 vg/m L-1 vg/m L之间有良好的线性关系;ELISA法测定kd值为20.71nmol/m L。本文利用适配体作为亲和材料继续研究从细胞裂解液中纯化rAAV。本研究进而选用具有广谱rAAV血清型的适配体结合在磁珠表面使之功能化,经过优化其功能化条件,获得能够与重组腺相关病毒(rAAV)选择性结合的新型亲和材料。应用该经适配体功能化后的磁珠从宿主细胞裂解物中提取、纯化腺相关病毒载体病毒颗粒。直接用磁棒或磁力架可实现纯化病毒的分离。适配体可以与链霉亲和素磁珠结合制备成亲和纯化柱用于rAAV纯化。纯化后rAAV细胞裂解液进行蛋白电泳,出现60 k Da:72 k Da:90 k Da=10:1:1,进行了纯化回收率优化,完成了链霉亲和素磁珠和生物素修饰的SEQ ID NO:23最佳比例优化,链霉亲和素磁珠和生物素修饰的适配体孵育时间优化,经适配体功能化的磁珠对rAAV载量优化,正交实验优化纯化系统中链霉亲和素磁珠,SEQ ID NO:23,rAAV的拷贝数比例,正交实验确定纯化系统的最优洗脱温度,洗脱缓冲液,上样量,验证优化好的条件的实验重复性,适配体功能化磁珠纯化出来的rAAV用Q型强阴离子交换柱去除空壳,强阴离子交换柱去除空壳后的AAV转染Hela细胞,通过阳性细胞数判断转染效率。对照实验中,适配体功能化磁珠可以用来纯化肝素所不能纯化的rAAV-5-GFP和重组腺相关病毒rAAV-7-GFP,羧基磁珠偶联AAV抗体制备抗体免疫磁珠做对照实验,核酸适体功能化磁珠的纯化能力与抗体相兼容,但基于核酸适体的工艺更简单,成本更低。
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