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家蚕性连锁平衡致死系(S14)是俄罗斯科学家V.A.Strunnikov等运用辐射诱变等手段培育而成的,品系两条Z染色体上分别带有一个隐性致死突变基因l1和l2 (lethal gene 1,l1和lethal gene 2, l2),l1和l2为非等位基因,致死时期分别是转青期和反转期终了,两个致死基因之间的交换率为0.8%。S14品系的W染色体上易位有一个包含+os显性性状基因的Z染色体片段,易位片段携带l1的正常等位基因,可以掩盖l1的致死作用。因此S14品系,W+l1 Z+l1·l2基因型雌蚕卵和Zl1·+l2/Zl1·+l2基因型雄蚕卵分别因l2和l1致死作用在胚胎期死亡;W+l1 Zl1·+l2基因型雌蚕卵和Zl1·+l2/Z+l1·l2基因型雄蚕卵存活发育成成虫。将S14品系的雄蛾与P50品系的雌蛾杂交,F1代雄蛾再与P50品系雌蛾回交。回交一代雌蛾根据父本(F1代雄蛾)携带l1或l2分成两类BCl-l1和BCl-l2两个回交种群,分别用来定位l1和l2致死基因。本研究的内容与结果:(1)已知os油蚕基因和l1致死基因连锁。据文献报道分子标记N20.80b与os油蚕性状标记连锁,N20.80b位于Z染色体精细物理图谱19.2 Mb位点附近,从家蚕全基因组数据库KAIKObase中下载N20.80b附近长5.7 Mb的Z染色体基因组序列。使用SSRHunterl.3软件对5.7 Mb基因组序列进行SSR标记搜寻,并根据SSR标记两端的单一序列设计上下游引物,共设计563对SSR特异性引物。(2)为筛选能区分S14品系Zl1·+l2和Z+l1·l2两条Z染色体的差异标记,用563对SSR特异性引物检测S14品系雌蛾与雄蛾基因组间的多态性,共获得10个差异标记,这些差异标记用以鉴定F1代雄蛾携带l1或l2。用563对SSR引物检测杂交F1代雄蛾基因组的多态性,分别筛选P50品系的Z染色体与S14品系系Zl1·+l2和Z+l1·l2条Z染色体的差异标记,其中P50的Z染色体和系Zl1·+l2染色体之间有16个差异标记,和系Z+l1·l2染色体之间有18个差异标记,这些差异标记分别用于BCl-l1和BCl-l2雌蛾基因型的检测。(3)通过对作图群体BCl-l1和BCl-l2雌蛾基因型的检测,分别构建了l1、l2致死基因和SSR标记之间的连锁图,结合SSR标记在Z染色体物理图谱中的位置,最终l1基因定位在物理图谱19.79 Mb位点到染色体末端(长约2.6 Mb)范围内;l2基因定位在物理图谱17.86 Mb位点到18.55 Mb位点(长约0.69 Mb)范围内。通过对比l1和l2的连锁图,发现5.7 Mb范围内Zl1·+l2染色体与P50 Z染色体间交换率0.82%,而Z+l1.l2染色体与P50 Z染色体间交换率9.28%,推测携带l1的Zl1.+l2染色体可能存在结构异常,从而抑制了Zl1+l2染色体和P50 Z染色体在5.7 Mb范围内的重组交换。(4)用位于l1定位的2.6 Mb区域的183对引物检测Zl1.+l2/Zl1.+l2基因型死亡胚胎、W+l1 Zl1.+l2基因型和Zl1.+l2/Z+l1.l2基因型存活胚胎三种基因组发现,携带l1的Zl1.+l2染色体缺失了末端大小约0.184 Mb的片段,而携带+l1的W+l1染色体携带Zl1.+l2染色体缺失的0.184 Mb片段。推测Zl1.+l2染色体缺失的0.184 Mb片段上有家蚕存活的必须基因,Zl1.+l2/Zl1.+l2基因型胚胎因必须基因缺失在转青期死亡。通过生物信息学方法对KAIKObase数据库预测的0.184 Mb片段内的功能基因进行分析,推测Pdp1基因(BGIBMGA003874)可能是致死基因l1的候选基因之一。