【摘 要】
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目的:分析临床血流感染中分离出的鲍曼不动杆菌的基因组特征,并探讨基因组特征与临床表型之间的相关性。方法:收集鲍曼不动杆菌血流感染的患者的临床资料,进行感染危险因素分析。将从血流感染中分离的鲍曼不动杆菌进行药敏实验,分析其耐药特征。并将菌株进行全基因组测序,得出同源关系、耐药基因和毒力基因。并根据同源关系挑选相应的菌株进行毒力实验,包括生物膜实验、血清抵抗实验和大蜡螟感染实验。分析鲍曼不动杆菌的毒力
【基金项目】
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北京市科委首都特色基金(Z151100004015208);
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目的:分析临床血流感染中分离出的鲍曼不动杆菌的基因组特征,并探讨基因组特征与临床表型之间的相关性。方法:收集鲍曼不动杆菌血流感染的患者的临床资料,进行感染危险因素分析。将从血流感染中分离的鲍曼不动杆菌进行药敏实验,分析其耐药特征。并将菌株进行全基因组测序,得出同源关系、耐药基因和毒力基因。并根据同源关系挑选相应的菌株进行毒力实验,包括生物膜实验、血清抵抗实验和大蜡螟感染实验。分析鲍曼不动杆菌的毒力特征。结果:收集152例鲍曼不动杆菌血流感染临床资料后,进行危险因素分析,留置中心静脉导管、机械通气为其独立的影响因素。鲍曼不动杆菌对多种药物的耐药率较高,对临床常见抗生素药物的耐药率分别为:环丙沙星88.16%(134)、左氧氟沙星56.58%(86)、复方新诺明50.66%(77)、庆大霉素75.66%(115)、妥布霉素63.16%(96)、氨苄西林/舒巴坦86.18%(131)、头孢吡肟87.50%(133)、头孢他啶86.84%(132)、亚胺培南88.16%(134)、头孢曲松 87.50%(133)。将基因组序列上传至相关网站后,得到多位点序列结果。使用牛津分型结果,一共有148株鉴定出18个ST型,分别为ST195,ST208,ST540,ST368,ST1779,ST938,ST369,ST373,ST191,ST229,ST2371,ST1684,ST381,ST2339,ST1598,ST1482,ST1377,ST1110。将得到的ST型进行克隆分型,可以分为CC92组包括ST369、ST540、ST1684、ST1779、ST191、ST195、ST208、ST368,ST381 和 ST938,其余 ST 型为非 CC92克隆分型。根据COG注释后的基因组功能大多都在“翻译、核糖结构和生物形成”、“翻译和转录”、“氨基酸的运输和代谢”、“能源生产和转换”和“细胞膜、细胞壁的形成”。在同源关系分析中,所有的菌株可以分为两簇为CC92和非CC92。对基因组序列的毒力和耐药分析显示,CC92分组中毒力基因几乎完全一致,除了ST1779和ST369携带了hemE基因。在部分ST中还有携带了pilE基因。所有的CC92分组中的菌株都携带了blaOX4-23基因。生物膜实验中,CC92组中生物膜形成阳性率为48.39%。在非CC92组中生物膜形成阳性率为66.67%。两组之间生物膜形成能力无显著性差异(P=0.1379)。在血清抵抗力实验中,有23株的对人的血清抵抗力较高,其在人血清中的存活率约为53.55%至140.23%。在大蜡螟实验中,鲍曼不动杆菌的ST型和其感染大蜡螟后死亡率有相关性(P<0.05)。高于AB5075菌株感染后的死亡率的菌株有22株,包括ST1684、ST369、ST368、ST195、ST191、ST2371、ST2339、ST2459、ST1779、ST1598、ST540、ST373、ST208。结论:血流感染中的鲍曼不动杆菌的耐药率较高,可归因于携带blaOXA-23编码基因。CC92是携带该基因的鲍曼不动杆菌中的主要克隆,应该被监测。我们需要关注在临床上鲍曼不动杆菌中广泛存在的涉及细菌运动和多糖生物合成的毒力因子。
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