肉牛脂代谢相关基因遗传多态性及其与延边牛肉质性状相关分析

来源 :延边大学 | 被引量 : 7次 | 上传用户:wjq12262024
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本研究以鲁西牛、南阳牛、延黄牛以及延边牛4个品种肉牛群体共计356个体为材料,采用序列分析技术结合生物信息学方法,研究了影响牛脂肪代谢的MC4R、LEPR、HSL、LPL、SCD等5个候选基因部分基因座位的SNP位点,探讨了试验牛群的遗传结构和遗传多样性;并对157头延边牛在上述位点的肉质性状指标进行了相关性分析,以期筛选出显著影响肉牛肉质性状的功能基因或分子标记,为肉牛种质资源保存与利用和延边牛高效选育提供遗传学依据。试验得到以下主要结果:1、在HSL基因发现7处突变,四个试验牛群体在1208bp、1537bp、1574bp、1729bp、1740bp、1869bp、与1921bp处的突变均处于中度多态和低度多态。其中,1729bpA→G的突变导致编码蛋白的氨基酸由谷氨酰胺突变为精氨酸,1740bpT→C的突变导致丝氨酸突变为脯氨酸,1869bpA→G的突变导致缬氨酸突变为异亮氨酸,1921bpA→G的突变导致谷氨酸突变为赖氨酸。与延边牛肉质性状相关分析表明:1208bp A→C位点与眼肌面积、系水力、亮度、肉豆寇酸、油酸、亚油酸、亚麻酸、丝氨酸、甘氨酸、丙氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸呈显著相关显著相关;1537bpA→C位点与蒸煮损失、滴水损失、黄色度显著相关;1729bp A→G位点与宰前活重、胴体重、背膘厚、肉豆寇酸、棕榈酸、亚油酸、丝氨酸、精氨酸、赖氨酸显著相关;1921bp A→G位点与宰前活重、胴体重、肉豆寇酸、亚油酸、亚麻酸、丝氨酸、甘氨酸、丙氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、脯氨酸、赖氨酸显著相关。2、在LPL基因329bp的A→T突变在延边牛群体中处于中度多态,其余牛群体均处于低度多态;该突变引起苏氨酸突变为丝氨酸,与延边牛眼肌面积、蒸煮损失、滴水损失、PH、肉豆蔻酸、亚油酸、丝氨酸、甘氨酸、丙氨酸、赖氨酸显著相关;3、在LEPR基因2831bp的C→T突变在四个牛群体中均处于中度多态,使苏氨酸突变为蛋氨酸,引起了疏水性结构改变,导致蛋白质二级结构在第940处左右出现一个α螺旋丢失、β折叠增加,改变了三级结构中α螺旋、β转角的空间位置,经相关分析表明该位点与延边牛背膘厚、眼肌面积、蒸煮损失显著相关。4、在MC4R基因1069bp发现C→G的突变在四个牛群体中属于中度多态,引起亮氨酸突变为缬氨酸,疏水性结构改变,导致蛋白质二级结构在166、243、281处出现α螺旋丢失、β折叠丢失,三级结构中β转角的空间位置发生改变。相关分析表明该位点与延边牛背膘厚、亮度、黄色度、肉豆蔻酸、亚油酸及亚麻酸显著相关。5、在SCD基因发现3处突变在四个牛群体中均处于中度多态。其中,1022bp处的突变使编码蛋白的氨基酸由丙氨酸突变为缬氨酸,导致了疏水性结构改变,表现为缬氨酸编码蛋白的疏水性高于丙氨酸编码蛋白的疏水性;引起蛋白质二级结构在第291处出现α螺旋的丢失、无规则卷曲丢失,289处出现β折叠丢失,但蛋白质三级结构没有变化。相关分析表明846bp A→G的突变与延边牛宰前活重、胴体重、背膘厚、硬脂酸、亚油酸、天冬氨酸、谷氨酸、甘氨酸、丙氨酸含量显著相关,而1022 bpC→T的突变与天冬氨酸、酪氨酸、硬脂酸含量显著相关。
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