水资源是世界上最宝贵的资源之一，水污染却日益严重，这个污染的出现引起了世界各国政府的关注，治理水污染环境的课题也被列入世界环保组织的工作日程。 污水生态处理系统是当前污水处理中的研究热点，本文以石家庄机械步兵学院的污水生态处理系统为研究背景，通过实验对部分微生物进行计数，分析其随季节变化的规律，并以人工湿地处理系统为例，运用现代管理理论研究污水生态处理系统运行优化问题。 实验结果表明：从生物滤池进水到人工湿地出水，水样微生物中原生动物数量先增后减，但种类增加；而细菌、真菌及放线菌数量依次减少。季节变化对污水生态处理系统中的微生物数量有一定影响。水样中，细菌总数在十一月达到最多，真菌和放线菌总数在九月达到最多。土样中，深层土的细菌、真菌和放线菌总数在七月份时较多；亚硝化菌总数在十一月达到最多；从七月到十一月硝化菌总数依次减少；而反硝化菌和氨化菌总数增加。 由实验结果的分析可知，影响人工湿地子系统处理效果的因素有有机物含量、温度、植物种类、植物生长状况等，依据分析成果和管理原理，论文讨论了人工湿地子系统的运行管理，有助于污水生态处理系统运行效果的进一步提高。