食管癌和前列腺癌是两种常见的恶性肿瘤，严重威胁人类健康。食管癌在致死人数最多的癌症中居第六位，而前列腺癌在男性最常见癌症中居第二位，急需有效治疗手段。但食管癌和前列腺癌的致病机理仍不是很清楚，这也是治疗中的一大障碍。　　本研究试图通过寻找新的癌症相关的基因和化学分子来进一步系统地阐明食管癌和前列腺癌的致病机理。我们拓展了原本仅用于识别疾病基因的计算方法，利用已知的化学分子-化学分子相互作用、化学分子-蛋白质相互作用和蛋白质-蛋白质相互作用信息，构建出一个同时包含化学分子和蛋白质的混合网络。通过对此混合网络应用最短路径法，同时识别出新的癌症候选基因和化学分子。Jackknife检验表明，在识别能力上拓展算法优于或不亚于广泛使用的重启动随机游走法。对最终识别出的基因和化学分子进行的功能分析表明它们高度富集到与癌症有着直接或者间接关联的基因本体和KEGG通路上。另外，也讨论了部分候选基因和化学分子成为与食管癌及前列腺癌相关的新基因和新化学分子的可能性。